219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3342 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  100 
 
 		 403 aa  820    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  39.17 
 
 		 417 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  36.96 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  34.51 
 
 		 404 aa  229  8e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  36.12 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  32.38 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  31.68 
 
 		 413 aa  113  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  34.52 
 
 		 590 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  31.22 
 
 		 640 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  33.78 
 
 		 629 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  33.78 
 
 		 629 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  34.46 
 
 		 589 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  33.11 
 
 		 632 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  31.67 
 
 		 557 aa  91.3  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  31.33 
 
 		 619 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  32.87 
 
 		 299 aa  90.1  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  26.05 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  28.33 
 
 		 462 aa  87.4  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  39.05 
 
 		 596 aa  86.3  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  46.43 
 
 		 203 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  46.43 
 
 		 203 aa  86.3  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  46.43 
 
 		 203 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  34.76 
 
 		 562 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  29.59 
 
 		 750 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  48.81 
 
 		 207 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  45.24 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  45.24 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  32.73 
 
 		 617 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  48.81 
 
 		 207 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  34.26 
 
 		 858 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  48.81 
 
 		 207 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  47.62 
 
 		 207 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  48.81 
 
 		 206 aa  82  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  28.11 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  44.05 
 
 		 203 aa  82  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  47.62 
 
 		 206 aa  82  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  44.05 
 
 		 203 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  46.43 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  32.77 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  46.43 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  46.43 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  46.43 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  46.43 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  39.6 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  35.71 
 
 		 206 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  47.62 
 
 		 206 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  38.68 
 
 		 203 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  46.43 
 
 		 206 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  44.05 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  46.43 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  31.64 
 
 		 747 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  26.06 
 
 		 719 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  41.38 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  42.86 
 
 		 205 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  40.7 
 
 		 131 aa  74.3  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  41.67 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  42.86 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  40.22 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  37.37 
 
 		 202 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  32.26 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  37.36 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  35.24 
 
 		 207 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  29.35 
 
 		 614 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  37.65 
 
 		 206 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  35.45 
 
 		 115 aa  69.3  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  22.89 
 
 		 632 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  39.36 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  36.89 
 
 		 598 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  36.05 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  24.44 
 
 		 585 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  26.39 
 
 		 728 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  24.44 
 
 		 585 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  24.44 
 
 		 585 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  33.12 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  30.46 
 
 		 649 aa  66.6  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  34.92 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  34.48 
 
 		 647 aa  66.2  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  39.24 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  34.92 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  35.48 
 
 		 370 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  33.33 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  27.99 
 
 		 447 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  29.45 
 
 		 206 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  46.03 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  31.97 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  31.94 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  35.48 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  34.25 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  34 
 
 		 631 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  40.68 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  36.27 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  39.25 
 
 		 664 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  34.38 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  38.89 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  28.48 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0941  putative membrane protein, energy transducer  35.29 
 
 		 108 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1274  TonB domain protein  35.29 
 
 		 108 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  35.06 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  36.71 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  32.69 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>