71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3722 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 		 631 aa  1293    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  41.69 
 
 		 750 aa  290  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  35.71 
 
 		 651 aa  216  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  32.7 
 
 		 660 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  33.69 
 
 		 477 aa  194  5e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  34.82 
 
 		 581 aa  191  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  30.97 
 
 		 671 aa  180  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  30.12 
 
 		 700 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  29.97 
 
 		 598 aa  164  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  32.64 
 
 		 423 aa  107  7e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  23.58 
 
 		 858 aa  80.5  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  25.33 
 
 		 417 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  22.45 
 
 		 619 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  24.88 
 
 		 640 aa  73.9  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  23.65 
 
 		 629 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  25.54 
 
 		 632 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  23.65 
 
 		 629 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  24.87 
 
 		 589 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  26.7 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  27.7 
 
 		 596 aa  70.9  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  31.45 
 
 		 302 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  25.97 
 
 		 403 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  27.14 
 
 		 541 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  21.37 
 
 		 465 aa  68.9  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  27.04 
 
 		 728 aa  68.2  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  27.46 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  23.21 
 
 		 647 aa  65.1  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  26.47 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  28.26 
 
 		 631 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  27.12 
 
 		 617 aa  64.7  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  29.38 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  22.05 
 
 		 442 aa  63.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  24.54 
 
 		 562 aa  62.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  28.16 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  23.35 
 
 		 585 aa  60.5  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  23.35 
 
 		 585 aa  60.5  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  23.35 
 
 		 585 aa  60.5  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  27.62 
 
 		 719 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  34.15 
 
 		 465 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  28.25 
 
 		 330 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  25.2 
 
 		 750 aa  60.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3587  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1122 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479804  normal  0.0414977 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1881  peptidase M56, BlaR1  27.04 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  27.17 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  31.01 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  24.69 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  21.38 
 
 		 397 aa  57  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  21.8 
 
 		 632 aa  55.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  32.53 
 
 		 664 aa  55.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  29.11 
 
 		 590 aa  54.7  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  32.94 
 
 		 462 aa  54.7  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  30.77 
 
 		 328 aa  54.3  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  29.71 
 
 		 299 aa  53.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  27.72 
 
 		 447 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  24.09 
 
 		 747 aa  51.6  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  23.13 
 
 		 413 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3733  peptidase M56 BlaR1  28.91 
 
 		 596 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  28.26 
 
 		 361 aa  48.5  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2423  peptidase M56, BlaR1  32.99 
 
 		 380 aa  48.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906062  normal  0.563265 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  24.18 
 
 		 482 aa  48.1  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2248  putative prophage LambdaBa02, tape measure protein  26.79 
 
 		 1671 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0144482  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4097  peptidase M56 BlaR1  31.34 
 
 		 324 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  27.04 
 
 		 754 aa  47.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9019  peptidase M48 Ste24p  28.87 
 
 		 331 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4082  prophage LambdaBa02, tape measure protein  27.38 
 
 		 959 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.27862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3793  prophage LambdaBa02, tape measure protein  27.38 
 
 		 959 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  23.83 
 
 		 509 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2840  heat shock protein HtpX  25.62 
 
 		 294 aa  45.8  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0382582  normal  0.364163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  21.19 
 
 		 529 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2574  heat shock protein HtpX  29.03 
 
 		 290 aa  43.9  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3307  heat shock protein HtpX  25.97 
 
 		 292 aa  43.9  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.650708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>