79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3787 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 		 617 aa  1261    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  47.39 
 
 		 750 aa  577  1.0000000000000001e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2060  hypothetical protein  57.21 
 
 		 205 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.252771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  29.76 
 
 		 858 aa  176  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  27.61 
 
 		 629 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  27.61 
 
 		 629 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  28.15 
 
 		 632 aa  160  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  25.12 
 
 		 619 aa  159  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  28.89 
 
 		 640 aa  157  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  28.57 
 
 		 562 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  26.19 
 
 		 589 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  26.22 
 
 		 596 aa  123  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  25.45 
 
 		 747 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  29.2 
 
 		 719 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  25.13 
 
 		 647 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  32.4 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  24.23 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  29.1 
 
 		 728 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  24.77 
 
 		 585 aa  97.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  24.77 
 
 		 585 aa  97.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  24.77 
 
 		 585 aa  97.1  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  29.47 
 
 		 322 aa  95.1  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  27.18 
 
 		 614 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  24.29 
 
 		 632 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  21.83 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  24.29 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  31.65 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  38 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  26.12 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  25.33 
 
 		 754 aa  80.9  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  27.54 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  32.73 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  27.04 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  25.4 
 
 		 660 aa  77  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  28.28 
 
 		 590 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  30.09 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  25.07 
 
 		 465 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  24.23 
 
 		 671 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  32.17 
 
 		 750 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  27.15 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  39.74 
 
 		 413 aa  67  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  27.12 
 
 		 631 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  21.55 
 
 		 541 aa  64.7  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  34.95 
 
 		 477 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  28.07 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  35.05 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  25.37 
 
 		 467 aa  60.1  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0076  hypothetical protein  25.75 
 
 		 640 aa  59.7  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0823761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  29.91 
 
 		 651 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  23.26 
 
 		 557 aa  58.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  33.65 
 
 		 581 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  25 
 
 		 700 aa  56.6  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1404  hypothetical protein  24.32 
 
 		 636 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0164  peptidase M56 BlaR1  26.54 
 
 		 210 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  21.75 
 
 		 585 aa  55.1  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1589  hypothetical protein  25.6 
 
 		 636 aa  53.9  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  26.99 
 
 		 482 aa  53.9  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 		 664 aa  52  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  32.12 
 
 		 361 aa  52  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  21.76 
 
 		 585 aa  51.6  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2825  Beta-lactamase  30 
 
 		 405 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.141892  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  25.71 
 
 		 379 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  20.58 
 
 		 585 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3587  hypothetical protein  25.58 
 
 		 1122 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479804  normal  0.0414977 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  29.75 
 
 		 649 aa  49.3  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  25 
 
 		 447 aa  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  28.85 
 
 		 330 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2423  peptidase M56, BlaR1  28.07 
 
 		 380 aa  47.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906062  normal  0.563265 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3430  peptidase M56 BlaR1  25 
 
 		 447 aa  47.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0832  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  41.67 
 
 		 61 aa  47.4  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  25.17 
 
 		 467 aa  47  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  27.88 
 
 		 330 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  29.71 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1881  peptidase M56, BlaR1  26.09 
 
 		 556 aa  45.8  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1711  hypothetical protein  30.36 
 
 		 412 aa  45.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  27.37 
 
 		 647 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  31.08 
 
 		 330 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  25.57 
 
 		 624 aa  44.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3134  BlaR1 peptidase M56 domain protein  25.69 
 
 		 381 aa  44.3  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>