65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2068 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 		 632 aa  1295    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  32.93 
 
 		 647 aa  233  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  35.29 
 
 		 465 aa  199  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  26.22 
 
 		 750 aa  127  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  25.34 
 
 		 640 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  27.59 
 
 		 519 aa  124  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  24.31 
 
 		 629 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  24.31 
 
 		 629 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  24.38 
 
 		 632 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  26.24 
 
 		 858 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  27.22 
 
 		 719 aa  110  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  24.19 
 
 		 747 aa  108  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  23.7 
 
 		 617 aa  108  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  24.48 
 
 		 462 aa  103  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  27.36 
 
 		 614 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  24.24 
 
 		 619 aa  101  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  25.99 
 
 		 728 aa  96.3  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  22.31 
 
 		 589 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  29.73 
 
 		 442 aa  92.8  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  26.3 
 
 		 417 aa  88.6  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  26.18 
 
 		 562 aa  88.6  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  22.63 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  24.84 
 
 		 322 aa  84  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  26.32 
 
 		 302 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  26.74 
 
 		 596 aa  79.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  23.43 
 
 		 585 aa  76.3  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  23.43 
 
 		 585 aa  76.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  23.43 
 
 		 585 aa  76.3  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  24.6 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  25.89 
 
 		 754 aa  73.6  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  22.39 
 
 		 660 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  30.92 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  24.8 
 
 		 671 aa  70.5  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  21.93 
 
 		 649 aa  68.9  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  26.58 
 
 		 581 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  26.48 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  24.88 
 
 		 750 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  23.35 
 
 		 585 aa  68.6  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  22.86 
 
 		 404 aa  66.6  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  26.43 
 
 		 631 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  20.36 
 
 		 557 aa  62.4  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  23.01 
 
 		 585 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  20 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  21.57 
 
 		 590 aa  61.2  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  29.36 
 
 		 598 aa  60.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  23.36 
 
 		 585 aa  60.5  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3733  peptidase M56 BlaR1  27.34 
 
 		 596 aa  59.3  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  22.98 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  22.69 
 
 		 651 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  28.97 
 
 		 700 aa  58.5  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  22.35 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  29.63 
 
 		 664 aa  57  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  23.3 
 
 		 423 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  26.63 
 
 		 477 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  22.98 
 
 		 647 aa  53.9  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  25 
 
 		 541 aa  53.5  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3430  peptidase M56 BlaR1  27.81 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2825  Beta-lactamase  29.05 
 
 		 405 aa  52  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.141892  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  25.69 
 
 		 299 aa  51.2  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  25.74 
 
 		 509 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0164  peptidase M56 BlaR1  22.69 
 
 		 210 aa  47  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0832  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  38.78 
 
 		 61 aa  47  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  22.71 
 
 		 379 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  22.69 
 
 		 621 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  24.56 
 
 		 672 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>