38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3210 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  100 
 
 		 672 aa  1373    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  32.76 
 
 		 524 aa  151  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  29.21 
 
 		 563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2771  peptidase M56, BlaR1  29.79 
 
 		 515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0768816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  28.06 
 
 		 601 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  32.01 
 
 		 529 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4940  peptidase M56 BlaR1  34.65 
 
 		 583 aa  140  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  30.15 
 
 		 621 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  27.24 
 
 		 647 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  28.47 
 
 		 624 aa  109  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  28.3 
 
 		 660 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  29.97 
 
 		 583 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3430  peptidase M56 BlaR1  25.82 
 
 		 447 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0208  hypothetical protein  23.55 
 
 		 312 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.765915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  27.3 
 
 		 604 aa  101  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  26.03 
 
 		 438 aa  97.8  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  28.99 
 
 		 506 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  28.75 
 
 		 467 aa  97.1  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  26.19 
 
 		 379 aa  94  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  28.57 
 
 		 804 aa  84.3  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  25.99 
 
 		 472 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  26.71 
 
 		 668 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  22.5 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  26.54 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  24.3 
 
 		 754 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  27.22 
 
 		 614 aa  53.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  24.12 
 
 		 322 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  26.63 
 
 		 858 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  30.39 
 
 		 750 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1884  hypothetical protein  29.27 
 
 		 170 aa  49.7  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000308697  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  25.97 
 
 		 442 aa  49.3  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  28.26 
 
 		 447 aa  48.9  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  23.63 
 
 		 557 aa  48.5  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  26.47 
 
 		 302 aa  48.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3587  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1122 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479804  normal  0.0414977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  23.05 
 
 		 728 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  24.9 
 
 		 719 aa  45.8  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  25 
 
 		 619 aa  43.9  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>