74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1810 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  100 
 
 		 750 aa  1534    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  47.39 
 
 		 617 aa  587  1e-166  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2060  hypothetical protein  55.33 
 
 		 205 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.252771  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  30.79 
 
 		 619 aa  206  9e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  28.57 
 
 		 629 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  28.57 
 
 		 629 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  28.31 
 
 		 632 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  28.06 
 
 		 640 aa  189  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  27.12 
 
 		 589 aa  168  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  32.19 
 
 		 858 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  26.85 
 
 		 562 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  24.81 
 
 		 465 aa  138  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  26.14 
 
 		 647 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  28.38 
 
 		 462 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  27.5 
 
 		 596 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  27.86 
 
 		 719 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  25.94 
 
 		 585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  25.94 
 
 		 585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  25.94 
 
 		 585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  27.67 
 
 		 747 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  28.67 
 
 		 728 aa  108  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  26.45 
 
 		 632 aa  105  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  29.53 
 
 		 322 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  23.9 
 
 		 442 aa  98.6  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  27.61 
 
 		 614 aa  95.1  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  24.06 
 
 		 302 aa  89.4  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  25.1 
 
 		 598 aa  87.8  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  28.17 
 
 		 417 aa  87.4  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  25 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  26.88 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  27.62 
 
 		 660 aa  81.6  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  29.59 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  24.07 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  26.15 
 
 		 671 aa  79  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  30.41 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  25.3 
 
 		 585 aa  74.7  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  26.5 
 
 		 651 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  26.28 
 
 		 585 aa  72.4  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  21.67 
 
 		 519 aa  72.4  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  30.06 
 
 		 581 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  22.1 
 
 		 557 aa  70.1  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  24.39 
 
 		 754 aa  68.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  36.19 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  29.57 
 
 		 467 aa  67  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  36.9 
 
 		 750 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  24.93 
 
 		 465 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  24.15 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  25.56 
 
 		 590 aa  63.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  21.84 
 
 		 631 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  29.2 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  29.25 
 
 		 700 aa  58.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0164  peptidase M56 BlaR1  22.62 
 
 		 210 aa  54.7  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  27.82 
 
 		 664 aa  53.5  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1881  peptidase M56, BlaR1  28.57 
 
 		 556 aa  53.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  26.43 
 
 		 541 aa  52.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2825  Beta-lactamase  30 
 
 		 405 aa  51.6  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.141892  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  22.67 
 
 		 413 aa  51.2  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2771  peptidase M56, BlaR1  27.1 
 
 		 515 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0768816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  30.39 
 
 		 672 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  24.42 
 
 		 524 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  25.58 
 
 		 482 aa  48.9  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  24.69 
 
 		 447 aa  47.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  27.1 
 
 		 601 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  33.78 
 
 		 624 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2832  peptidase M56, BlaR1, putative  32.76 
 
 		 191 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0633129  hitchhiker  0.0000000840158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  27.41 
 
 		 509 aa  45.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  28.1 
 
 		 529 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  28.07 
 
 		 330 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1807  peptidase M56 BlaR1  31.33 
 
 		 328 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  32.22 
 
 		 361 aa  45.4  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  29.2 
 
 		 330 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  21.43 
 
 		 379 aa  45.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  22.37 
 
 		 647 aa  44.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  28.43 
 
 		 631 aa  44.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>