58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3883 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 		 299 aa  583  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  35.6 
 
 		 361 aa  125  7e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  35.58 
 
 		 590 aa  124  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  37.1 
 
 		 403 aa  87.8  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  29.11 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  40.45 
 
 		 629 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  40.45 
 
 		 629 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  40.45 
 
 		 640 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  40.45 
 
 		 632 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  30.87 
 
 		 589 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  30.25 
 
 		 557 aa  74.3  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  36.45 
 
 		 596 aa  73.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  29.17 
 
 		 462 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  28.11 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  29.71 
 
 		 728 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  26.4 
 
 		 619 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  32.34 
 
 		 614 aa  70.5  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  31.41 
 
 		 750 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  24.73 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  32.14 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  21.67 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  25.99 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  38.55 
 
 		 562 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 		 719 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  36.08 
 
 		 598 aa  63.9  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  20.61 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  29.53 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  35.05 
 
 		 617 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  32.11 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  25.25 
 
 		 754 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  32.99 
 
 		 858 aa  57.4  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  26.15 
 
 		 541 aa  56.6  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  25.66 
 
 		 647 aa  56.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  35.35 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  31.25 
 
 		 631 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  33.04 
 
 		 747 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  30.67 
 
 		 671 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  28.65 
 
 		 581 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  27.71 
 
 		 585 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  27.71 
 
 		 585 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  27.71 
 
 		 585 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  25 
 
 		 477 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  23.26 
 
 		 585 aa  48.9  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  35.38 
 
 		 624 aa  48.9  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  26.02 
 
 		 519 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  24.03 
 
 		 585 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 		 750 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  36.71 
 
 		 509 aa  47  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2825  Beta-lactamase  23.44 
 
 		 405 aa  47  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.141892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  28.9 
 
 		 660 aa  46.2  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  25.69 
 
 		 632 aa  45.8  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  29.71 
 
 		 482 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  23.26 
 
 		 585 aa  44.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  28.24 
 
 		 467 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  28.95 
 
 		 651 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  31.17 
 
 		 700 aa  43.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  25.25 
 
 		 379 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  23.4 
 
 		 467 aa  42.7  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>