38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1288 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  100 
 
 		 647 aa  1348    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  32.59 
 
 		 524 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  35.69 
 
 		 529 aa  158  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  31.67 
 
 		 563 aa  152  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2771  peptidase M56, BlaR1  30.82 
 
 		 515 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0768816  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4940  peptidase M56 BlaR1  33.09 
 
 		 583 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  27.85 
 
 		 601 aa  138  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  29.19 
 
 		 621 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  27.24 
 
 		 672 aa  128  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  27.59 
 
 		 467 aa  122  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  29.55 
 
 		 804 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  31.6 
 
 		 604 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3430  peptidase M56 BlaR1  27.21 
 
 		 447 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  26.84 
 
 		 624 aa  101  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  31.36 
 
 		 438 aa  97.8  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  26.84 
 
 		 413 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  29.27 
 
 		 668 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  30.04 
 
 		 583 aa  95.1  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  26.69 
 
 		 379 aa  90.1  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  25.17 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  29.21 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  27.38 
 
 		 719 aa  63.9  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  23.5 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  23.76 
 
 		 462 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  24.42 
 
 		 442 aa  55.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  28.91 
 
 		 858 aa  53.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  25.28 
 
 		 632 aa  51.2  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  23.22 
 
 		 557 aa  50.8  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  22.22 
 
 		 465 aa  50.8  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  23.95 
 
 		 728 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  22.73 
 
 		 754 aa  48.9  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  27.97 
 
 		 671 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  23.39 
 
 		 423 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  23.49 
 
 		 614 aa  47.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  26.14 
 
 		 361 aa  47.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  38.81 
 
 		 747 aa  45.8  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  24.49 
 
 		 403 aa  46.2  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  27.37 
 
 		 617 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>