72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_1176 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  69.18 
 
 
589 aa  780    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  100 
 
 
640 aa  1318    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  69.63 
 
 
629 aa  868    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  69.63 
 
 
629 aa  868    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  70.25 
 
 
632 aa  877    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  47.87 
 
 
619 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  29.43 
 
 
858 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  28.73 
 
 
750 aa  192  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  28.89 
 
 
617 aa  171  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  29.2 
 
 
562 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  24.51 
 
 
747 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  25.69 
 
 
404 aa  111  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  25.15 
 
 
632 aa  110  7.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  25.17 
 
 
596 aa  109  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  37.57 
 
 
417 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  27.4 
 
 
442 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  24.33 
 
 
465 aa  101  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  33.33 
 
 
405 aa  98.6  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  21.75 
 
 
462 aa  97.4  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  25.71 
 
 
397 aa  94.4  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2757  hypothetical protein  28.27 
 
 
332 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000641523  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2969  hypothetical protein  28.27 
 
 
332 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000854326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2965  hypothetical protein  28.01 
 
 
332 aa  92  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000111678 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0832  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  63.16 
 
 
61 aa  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  22.63 
 
 
728 aa  90.1  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  31.22 
 
 
403 aa  90.1  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  22.6 
 
 
647 aa  89.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  22.12 
 
 
719 aa  88.6  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3471  peptidase M56 BlaR1  22.92 
 
 
322 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2520  methicillin-resistance regulatory protein MecR1  21.66 
 
 
585 aa  84.7  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00119182  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0030  Beta-lactamase  21.66 
 
 
585 aa  84.7  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0030  Beta-lactamase  21.66 
 
 
585 aa  84.7  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  23.26 
 
 
614 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  27.91 
 
 
671 aa  80.5  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  24.83 
 
 
302 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  24.64 
 
 
750 aa  77.4  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3883  peptidase M56 BlaR1  40.45 
 
 
299 aa  76.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.155666  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  21.64 
 
 
598 aa  74.7  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  31.25 
 
 
467 aa  71.6  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  26.14 
 
 
631 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  26.29 
 
 
585 aa  71.2  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  21.1 
 
 
660 aa  71.2  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  25.82 
 
 
651 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  24.75 
 
 
590 aa  70.5  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  26.34 
 
 
700 aa  66.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  21 
 
 
581 aa  64.7  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  28.5 
 
 
477 aa  64.3  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0360  peptidase M56, BlaR1  22.83 
 
 
557 aa  62.4  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.777331 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0004  regulatory protein BlaR1  21.78 
 
 
585 aa  61.6  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0356117  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  20.75 
 
 
519 aa  60.8  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  30.21 
 
 
423 aa  55.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0077  peptidase M56 BlaR1  24.34 
 
 
664 aa  54.7  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.559375 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1590  peptidase M56, BlaR1  21.17 
 
 
754 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  21.26 
 
 
649 aa  53.9  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  29.21 
 
 
541 aa  53.1  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  25.93 
 
 
413 aa  53.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1878  peptidase M56 BlaR1  28.12 
 
 
330 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.101036  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1963  peptidase M56 BlaR1  28.12 
 
 
330 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2000  peptidase M56, BlaR1  28.12 
 
 
330 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2748  Beta-lactamase  21.27 
 
 
585 aa  51.6  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.282517  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  24.32 
 
 
447 aa  51.2  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  26.27 
 
 
509 aa  50.8  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  22.92 
 
 
467 aa  50.4  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02323  peptidase, M56 family protein  23.61 
 
 
361 aa  50.4  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.321617  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  21.4 
 
 
379 aa  50.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  28.67 
 
 
668 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  20.91 
 
 
465 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2423  peptidase M56, BlaR1  29.94 
 
 
380 aa  46.6  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906062  normal  0.563265 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  25.12 
 
 
482 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  20.74 
 
 
583 aa  44.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  33.75 
 
 
279 aa  43.9  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  29.1 
 
 
472 aa  44.3  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>