66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07981 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07981  TonB  100 
 
 		 467 aa  946    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  24.38 
 
 		 604 aa  158  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  25.32 
 
 		 506 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  26.44 
 
 		 413 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01195  TonB  58.97 
 
 		 239 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.325622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  35.19 
 
 		 668 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01190  TonB  54.24 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.517811  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  25.21 
 
 		 472 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  28.17 
 
 		 804 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  25.1 
 
 		 583 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  32.58 
 
 		 624 aa  127  6e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  27.59 
 
 		 647 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  30.08 
 
 		 601 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2771  peptidase M56, BlaR1  29.48 
 
 		 515 aa  113  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0768816  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  30.94 
 
 		 621 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  23.91 
 
 		 438 aa  106  9e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  28.57 
 
 		 529 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  28.52 
 
 		 524 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  29.12 
 
 		 563 aa  101  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  28.75 
 
 		 672 aa  97.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4940  peptidase M56 BlaR1  29.01 
 
 		 583 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3430  peptidase M56 BlaR1  27.64 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  27.05 
 
 		 379 aa  87  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  32.05 
 
 		 245 aa  73.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06335  hypothetical protein  25.89 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.833471  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13313  TonB  32.77 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248592  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  24.57 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  47.06 
 
 		 267 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  32.76 
 
 		 150 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1657  hypothetical protein  34.91 
 
 		 702 aa  56.6  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  31.62 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  45.9 
 
 		 156 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  40.48 
 
 		 222 aa  56.2  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  27.56 
 
 		 276 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  31.25 
 
 		 274 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  41.33 
 
 		 275 aa  53.9  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  32.48 
 
 		 279 aa  53.9  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  31.86 
 
 		 274 aa  53.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  22.19 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  31.01 
 
 		 156 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  22.22 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  22.7 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  23.32 
 
 		 632 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  22.92 
 
 		 640 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  30.05 
 
 		 614 aa  50.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  34.67 
 
 		 221 aa  50.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  25.77 
 
 		 562 aa  50.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  25 
 
 		 858 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  35.62 
 
 		 230 aa  48.9  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  30.1 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2423  peptidase M56, BlaR1  23.33 
 
 		 380 aa  47.8  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.906062  normal  0.563265 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3668  peptidase M56 BlaR1  30.1 
 
 		 509 aa  47.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  22.92 
 
 		 629 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  21.45 
 
 		 404 aa  47  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  22.92 
 
 		 629 aa  47  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  25.17 
 
 		 617 aa  47  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  27.64 
 
 		 325 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1355  peptidase M56 BlaR1  30.83 
 
 		 519 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  24.4 
 
 		 462 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  34.38 
 
 		 596 aa  45.1  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  30.88 
 
 		 379 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  24.82 
 
 		 631 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1460  regulatory protein BlaR1  29.27 
 
 		 585 aa  44.3  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000102574  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  33.33 
 
 		 258 aa  43.9  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  27.19 
 
 		 288 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  36.67 
 
 		 143 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>