75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3522 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  100 
 
 		 150 aa  306  5e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  59.41 
 
 		 276 aa  134  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  52.59 
 
 		 274 aa  130  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  51.96 
 
 		 274 aa  120  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  49.14 
 
 		 804 aa  120  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  45.74 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  45.95 
 
 		 506 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  44.44 
 
 		 472 aa  117  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  48 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  47.22 
 
 		 668 aa  110  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  45.19 
 
 		 275 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  47.47 
 
 		 156 aa  104  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  46.67 
 
 		 279 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  47.12 
 
 		 485 aa  102  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  41.53 
 
 		 279 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  42.57 
 
 		 288 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  48 
 
 		 484 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  43.1 
 
 		 413 aa  100  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  41.51 
 
 		 230 aa  99.4  1e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  44.23 
 
 		 267 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  42.86 
 
 		 379 aa  92.8  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  48.39 
 
 		 489 aa  90.1  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  40.19 
 
 		 438 aa  87.8  5e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  40.2 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  38.54 
 
 		 325 aa  87  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  39.42 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  42 
 
 		 222 aa  84.3  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  43.16 
 
 		 276 aa  83.6  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  34.65 
 
 		 604 aa  80.5  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  40.2 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  38.83 
 
 		 238 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  43.18 
 
 		 221 aa  67  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2717  tonB-related protein  29.06 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00561368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  30.34 
 
 		 583 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  32.76 
 
 		 467 aa  58.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  28.7 
 
 		 276 aa  57  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2650  tonB-related protein  29.13 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.5506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0189  TonB family protein  28.32 
 
 		 245 aa  53.9  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.700482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  34.18 
 
 		 446 aa  53.5  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1524  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5643  hypothetical protein  29.29 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  40.68 
 
 		 288 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  35.44 
 
 		 263 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  33.77 
 
 		 270 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  33.77 
 
 		 268 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  32.04 
 
 		 447 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  28.44 
 
 		 250 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  28.89 
 
 		 267 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4165  TonB family protein  30.69 
 
 		 216 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000230804  hitchhiker  0.00000000895205 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  28.21 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  33.33 
 
 		 249 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  28.7 
 
 		 271 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  36 
 
 		 283 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0189  hypothetical protein  40.3 
 
 		 437 aa  44.3  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.562826 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  31.17 
 
 		 255 aa  43.9  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01195  TonB  27.59 
 
 		 239 aa  43.5  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.325622  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  36.51 
 
 		 295 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  32.38 
 
 		 275 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  26.58 
 
 		 253 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  29.67 
 
 		 269 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  34.92 
 
 		 300 aa  42  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  34.92 
 
 		 298 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  36.51 
 
 		 299 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  37.5 
 
 		 244 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  34.92 
 
 		 319 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  34.92 
 
 		 301 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  34.92 
 
 		 297 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  34.92 
 
 		 301 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  36.51 
 
 		 300 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  36.51 
 
 		 297 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  34.92 
 
 		 301 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  37.74 
 
 		 300 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  29.49 
 
 		 441 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  33.77 
 
 		 244 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  33.77 
 
 		 244 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>