96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0350 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  100 
 
 
295 aa  578  1e-164  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  47.04 
 
 
288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  38.11 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  37.23 
 
 
291 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  37.23 
 
 
291 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  32.85 
 
 
294 aa  138  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  33.57 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  36.27 
 
 
291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  41.67 
 
 
300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  35.44 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  38.38 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  35.09 
 
 
300 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  34.66 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  33.8 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  33.91 
 
 
300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  33.8 
 
 
319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  34.52 
 
 
301 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  34.78 
 
 
298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  29.82 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  34.16 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  34.16 
 
 
301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  41.3 
 
 
294 aa  113  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  32.99 
 
 
307 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  36.29 
 
 
279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  30.88 
 
 
296 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  31.8 
 
 
299 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  25.99 
 
 
316 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  35.25 
 
 
297 aa  102  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  29.28 
 
 
333 aa  95.9  7e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  30.73 
 
 
250 aa  92.4  8e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  27.86 
 
 
323 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  27.37 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  30.71 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  28.88 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  25.82 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  23.79 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  28.97 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  24.64 
 
 
282 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1646  TonB family protein  28.5 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0972936  hitchhiker  0.00122452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1978  TonB family protein  28.5 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  32.11 
 
 
296 aa  60.5  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  25.45 
 
 
304 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  24.09 
 
 
286 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2689  TonB family protein  29.46 
 
 
264 aa  59.3  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2313  hypothetical protein  29.46 
 
 
264 aa  59.3  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8827  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  25.35 
 
 
287 aa  59.3  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  24.64 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1624  TonB-like  31.33 
 
 
285 aa  57.4  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0946322  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  29.82 
 
 
246 aa  55.8  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  35.78 
 
 
244 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  28.5 
 
 
292 aa  54.3  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  32.61 
 
 
324 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  21.09 
 
 
249 aa  53.1  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  35 
 
 
264 aa  52.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  28.96 
 
 
336 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  33.33 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  25 
 
 
328 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  27.66 
 
 
282 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  48 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2895  TonB family protein  29.35 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  26.22 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  24.67 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  25.77 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  32.82 
 
 
237 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  30.56 
 
 
265 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0466  TonB domain protein  28.57 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3297  TonB family protein  29.35 
 
 
230 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  45 
 
 
441 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  36.36 
 
 
272 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  29.31 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  38.27 
 
 
174 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  23.72 
 
 
212 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  30.34 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  29.09 
 
 
295 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  48.98 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  31.94 
 
 
297 aa  43.9  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  23.23 
 
 
306 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  35.29 
 
 
239 aa  43.5  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  29.83 
 
 
242 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  29.83 
 
 
242 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  40.74 
 
 
202 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  40.74 
 
 
164 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  42.86 
 
 
274 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  23.05 
 
 
304 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  40 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  26.79 
 
 
227 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  23.05 
 
 
304 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  34.43 
 
 
371 aa  42.7  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  27.72 
 
 
245 aa  42.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  36.51 
 
 
150 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  32 
 
 
269 aa  42.7  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  36.73 
 
 
371 aa  42.7  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  35.21 
 
 
241 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  33.33 
 
 
283 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  31.19 
 
 
284 aa  42.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  32.18 
 
 
237 aa  42.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.533007 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>