29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2313 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2689  TonB family protein  100 
 
 		 264 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2313  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  530  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  32.04 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  29.46 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1646  TonB family protein  31.82 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0972936  hitchhiker  0.00122452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1978  TonB family protein  31.82 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  34.74 
 
 		 279 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  34.38 
 
 		 300 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  30.61 
 
 		 307 aa  52  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  28.26 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  30.53 
 
 		 288 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  31.19 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  33.33 
 
 		 301 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  29.47 
 
 		 250 aa  50.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  33.33 
 
 		 301 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  32.29 
 
 		 298 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  33.33 
 
 		 301 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  32.29 
 
 		 297 aa  48.9  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  33.33 
 
 		 300 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  33.33 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  30.43 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  28.85 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  32.29 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  30.21 
 
 		 319 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  28.57 
 
 		 316 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  28.26 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  30.21 
 
 		 297 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  26.26 
 
 		 294 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  28.57 
 
 		 304 aa  42.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.140923 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>