82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3679 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  100 
 
 
307 aa  613  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  46.55 
 
 
296 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  43.77 
 
 
316 aa  230  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  45.72 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  38.8 
 
 
333 aa  171  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  35.42 
 
 
304 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  35.42 
 
 
304 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  38.62 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  33.45 
 
 
288 aa  159  6e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  36.01 
 
 
328 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  36.11 
 
 
304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  38.33 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  37.83 
 
 
298 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  37.67 
 
 
319 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  34.03 
 
 
296 aa  147  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  36.08 
 
 
306 aa  145  6e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  35.54 
 
 
286 aa  142  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  36.92 
 
 
291 aa  142  8e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  33.45 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  36.56 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  36.02 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  35.38 
 
 
294 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  36.75 
 
 
291 aa  139  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  34.25 
 
 
300 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  36.56 
 
 
301 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  32.49 
 
 
282 aa  136  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  34.59 
 
 
301 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  36.25 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  32.97 
 
 
304 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  34.04 
 
 
294 aa  130  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  34.25 
 
 
297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  32.73 
 
 
286 aa  129  6e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  33.22 
 
 
300 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  33.33 
 
 
288 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  41.38 
 
 
279 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  35.02 
 
 
299 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  37.97 
 
 
297 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  32.35 
 
 
287 aa  123  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  31.43 
 
 
286 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  33.1 
 
 
283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  32.02 
 
 
304 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  32.31 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  32.25 
 
 
287 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  34.81 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  31.62 
 
 
295 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  31.5 
 
 
295 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  27.24 
 
 
250 aa  86.7  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1978  TonB family protein  30.65 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1646  TonB family protein  30.65 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0972936  hitchhiker  0.00122452 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2711  GETHR pentapeptide  40 
 
 
654 aa  77  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.653885  hitchhiker  0.000850272 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  26.5 
 
 
323 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  24.03 
 
 
323 aa  72.4  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0237  TonB family protein  27.24 
 
 
256 aa  67  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2313  hypothetical protein  30.61 
 
 
264 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8827  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2689  TonB family protein  30.61 
 
 
264 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  34.04 
 
 
289 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  51.11 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  26.72 
 
 
297 aa  50.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  37.5 
 
 
292 aa  49.3  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  48.89 
 
 
287 aa  48.9  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  27.87 
 
 
283 aa  49.3  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  36.36 
 
 
308 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  37.21 
 
 
244 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  26.26 
 
 
235 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  37.18 
 
 
246 aa  47  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  26.51 
 
 
248 aa  46.6  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  41.27 
 
 
285 aa  45.8  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0858  TonB-dependent receptor, putative  23.68 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00190793  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  38.89 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  50 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  28.66 
 
 
239 aa  44.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  42.86 
 
 
164 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  24.22 
 
 
282 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  24.22 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  22.59 
 
 
282 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  40 
 
 
269 aa  43.5  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  24.59 
 
 
281 aa  43.5  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  42.86 
 
 
202 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  42 
 
 
270 aa  43.1  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5246  hypothetical protein  43.75 
 
 
708 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.733129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  24.59 
 
 
281 aa  43.1  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  33.33 
 
 
241 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>