81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3636 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  601  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  40.69 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  43.01 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  40.88 
 
 		 286 aa  205  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  39.86 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  39.86 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  40.22 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  39.86 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  40.51 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  39.86 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  39.08 
 
 		 301 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  39.78 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  39.71 
 
 		 299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  37.6 
 
 		 297 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  34.15 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  32.75 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  31.58 
 
 		 291 aa  132  6.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  31.58 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  32.62 
 
 		 295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  34.28 
 
 		 307 aa  129  6e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  32.37 
 
 		 294 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  32.51 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  30.98 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  30.84 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  42.64 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  45.3 
 
 		 279 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  29.15 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  29.15 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  26.64 
 
 		 323 aa  104  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  43.75 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  30.52 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  28.76 
 
 		 250 aa  99  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  25.91 
 
 		 323 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  43.86 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  29.11 
 
 		 328 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  29.69 
 
 		 304 aa  95.9  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  29.17 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  28.35 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  28.32 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  28.83 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  28.21 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  27.84 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  26.37 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  23.66 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  32.64 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  33.33 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  32.77 
 
 		 304 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1624  TonB-like  30.09 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0946322  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  31.78 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1978  TonB family protein  36.05 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1646  TonB family protein  36.05 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0972936  hitchhiker  0.00122452 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2711  GETHR pentapeptide  35.48 
 
 		 654 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.653885  hitchhiker  0.000850272 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0237  TonB family protein  26.39 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  37.35 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  30 
 
 		 283 aa  52.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  44.07 
 
 		 244 aa  49.7  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  39.62 
 
 		 174 aa  47.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  35 
 
 		 264 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  30.38 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  35.44 
 
 		 252 aa  46.2  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  45.83 
 
 		 285 aa  46.2  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  31.58 
 
 		 297 aa  45.8  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  41.27 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2313  hypothetical protein  26.26 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.8827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2895  TonB family protein  31.18 
 
 		 236 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  29.07 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2689  TonB family protein  26.26 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3297  TonB family protein  31.18 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  37.84 
 
 		 279 aa  45.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  29.07 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  38.1 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  46.34 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  31.65 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  27.18 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  33.33 
 
 		 411 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  33.77 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  33.33 
 
 		 220 aa  43.5  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  28.87 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  35.29 
 
 		 261 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  27.63 
 
 		 282 aa  42.7  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  39.68 
 
 		 287 aa  42.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>