102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01600 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  100 
 
 		 291 aa  581  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  73.33 
 
 		 291 aa  418  1e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  73.33 
 
 		 291 aa  419  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  71.38 
 
 		 294 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  41.44 
 
 		 292 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  34.77 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  37.5 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  35.76 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  36.55 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  36.54 
 
 		 319 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  36.88 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  37.28 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  36.62 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  37.37 
 
 		 301 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  37.01 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  36.75 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  34.33 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  36.62 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  36.39 
 
 		 294 aa  142  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  31.82 
 
 		 286 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  32.51 
 
 		 294 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  34.22 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  35.47 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  34.53 
 
 		 295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  33.71 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  32.98 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  30.84 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  32 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  29.93 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  35.43 
 
 		 306 aa  93.6  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  31.46 
 
 		 304 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  31.68 
 
 		 304 aa  92.8  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  33.1 
 
 		 328 aa  92.8  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  29.37 
 
 		 323 aa  92.4  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  29.74 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  33.72 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  30.08 
 
 		 304 aa  86.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  30.56 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  29.48 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  33.61 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  29.63 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  26.6 
 
 		 286 aa  75.5  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  27.68 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  26.87 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  27.68 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  27.09 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  37.12 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  28.8 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2711  GETHR pentapeptide  43.55 
 
 		 654 aa  64.3  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.653885  hitchhiker  0.000850272 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  44.71 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  28.03 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  27.34 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  33.68 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  32.63 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  32.63 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  36.46 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  40 
 
 		 248 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  26.07 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  35.53 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  44.44 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  43.1 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  36.36 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  38.96 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1146  TonB family protein  40.54 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.167411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1646  TonB family protein  26.7 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0972936  hitchhiker  0.00122452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1978  TonB family protein  26.7 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  39.66 
 
 		 336 aa  47  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  40 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  38.33 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  28.57 
 
 		 277 aa  46.6  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  27.43 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  35.56 
 
 		 263 aa  45.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  44.83 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  37.18 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  26.76 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2127  TonB-like  40.26 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0144571  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  46.3 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  32.43 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  51.11 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  31.37 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  35.14 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  31.25 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  32.43 
 
 		 220 aa  44.3  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  47.83 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  47.83 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  40.26 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  43.1 
 
 		 270 aa  44.3  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  32.05 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2278  TonB family protein  36.05 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  33.33 
 
 		 305 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1560  TonB family protein  34.67 
 
 		 537 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.139484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  52.27 
 
 		 285 aa  43.1  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2079  TonB family protein  36.84 
 
 		 126 aa  42.7  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  36.99 
 
 		 269 aa  42.7  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0858  TonB-dependent receptor, putative  26.84 
 
 		 293 aa  42.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00190793  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  41.38 
 
 		 283 aa  42.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  26.6 
 
 		 282 aa  42.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  34.72 
 
 		 230 aa  42.4  0.01  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  34.25 
 
 		 267 aa  42.4  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  34.25 
 
 		 267 aa  42.4  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>