55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2801 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  100 
 
 		 282 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  50.71 
 
 		 282 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  50.5 
 
 		 297 aa  247  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2891  TonB family protein  56.79 
 
 		 283 aa  245  6.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  50.35 
 
 		 281 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  48.81 
 
 		 281 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0858  TonB-dependent receptor, putative  48.45 
 
 		 293 aa  223  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00190793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  34.9 
 
 		 272 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  33.75 
 
 		 288 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2626  TonB family protein  28.45 
 
 		 419 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2720  TonB family protein  28.45 
 
 		 419 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1239  TonB-like protein  28.45 
 
 		 431 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.234262  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  22.39 
 
 		 300 aa  52.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  23.19 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  22.31 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  28.16 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  29.66 
 
 		 308 aa  49.7  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  27.66 
 
 		 295 aa  49.3  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  28.81 
 
 		 294 aa  49.3  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  25.78 
 
 		 316 aa  49.3  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  26.23 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  26.88 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  28.1 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  31.82 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  37.7 
 
 		 298 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  27.71 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  29.76 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  31.25 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  31.25 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  31.25 
 
 		 301 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  39.34 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  39.34 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  34.33 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  31.25 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  29.73 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  39.34 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2072  hypothetical protein  38.24 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.105388  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  24.71 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  42 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  32.93 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  24.22 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  32.93 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  40 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  25 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  35.14 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  26.47 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  26.47 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  36.07 
 
 		 297 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  28.57 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  25.25 
 
 		 336 aa  43.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  29.58 
 
 		 174 aa  43.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  29.76 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  36 
 
 		 252 aa  42.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  26.74 
 
 		 273 aa  42.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  27.63 
 
 		 294 aa  42.4  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>