57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0936 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  100 
 
 		 283 aa  573  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  64.96 
 
 		 282 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  61.19 
 
 		 285 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  61.68 
 
 		 304 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  61.31 
 
 		 286 aa  348  7e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  59.57 
 
 		 287 aa  340  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  60.87 
 
 		 286 aa  339  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  58.55 
 
 		 304 aa  316  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  58.36 
 
 		 287 aa  300  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  60.07 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  52.71 
 
 		 296 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  38.73 
 
 		 304 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  38.73 
 
 		 304 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  38.11 
 
 		 328 aa  165  9e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  40.07 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  38.73 
 
 		 304 aa  158  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  32.98 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  34.08 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  32.75 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  32.95 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  31.41 
 
 		 316 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  29.47 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0237  TonB family protein  29.83 
 
 		 256 aa  85.9  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  27.53 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  27.24 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  27.18 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  28.87 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  34.51 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  28.17 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  26.69 
 
 		 288 aa  72  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  29.84 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  27.27 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  28.72 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  29.5 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  29.5 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  28.72 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  27.61 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  24.57 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  31.85 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  31.85 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  35.4 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  25.56 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  36.61 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  29.09 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  30.43 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  24.28 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  28.17 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  24.64 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  26.67 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  29.51 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1173  TonB family protein  28.87 
 
 		 282 aa  45.8  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.140977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  30.68 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  30.68 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  27.37 
 
 		 235 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  29.91 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1646  TonB family protein  23.91 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0972936  hitchhiker  0.00122452 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1978  TonB family protein  23.91 
 
 		 275 aa  42.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.284174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>