49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2612 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  100 
 
 		 304 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  99.67 
 
 		 304 aa  613  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  89.14 
 
 		 304 aa  536  1e-151  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  65.76 
 
 		 328 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  63.16 
 
 		 306 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  41.64 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  40.14 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  41.41 
 
 		 285 aa  192  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  39.46 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  40.27 
 
 		 286 aa  189  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  39.93 
 
 		 304 aa  188  8e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  37.2 
 
 		 287 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  41.4 
 
 		 287 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  38.3 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  38.06 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  34.62 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  38.82 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  39.93 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  36.71 
 
 		 283 aa  155  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  39.57 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0237  TonB family protein  35.71 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  32.04 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  29.37 
 
 		 288 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  29.15 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  32.29 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  30.03 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  30.85 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  30.85 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  31.82 
 
 		 291 aa  99  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  31.82 
 
 		 291 aa  99  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  30.77 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  30.42 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  30.42 
 
 		 301 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  31.25 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  30.42 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  31.18 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  30.66 
 
 		 298 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  29.97 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  38.57 
 
 		 297 aa  86.3  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  27.89 
 
 		 294 aa  85.9  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  28.4 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  32.57 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  28.88 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  23.97 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  26.56 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  23.97 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  32.79 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  33.33 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  30.28 
 
 		 250 aa  54.3  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>