52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0842 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0842  TonB family protein  100 
 
 
286 aa  577  1e-164  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3655  TonB family protein  78.67 
 
 
304 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2965  TonB family protein  78.32 
 
 
286 aa  456  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1483  TonB family protein  74.91 
 
 
287 aa  438  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129671  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1088  TonB-like  71.06 
 
 
282 aa  403  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.764781  normal  0.470087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2196  TonB family protein  74.56 
 
 
287 aa  388  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.770144 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3412  TonB-like  65.11 
 
 
285 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3406  TonB family protein  62.11 
 
 
304 aa  338  8e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0936  TonB family protein  60.87 
 
 
283 aa  335  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.408733  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3200  periplasmic protein/ biopolymer transport  66.06 
 
 
296 aa  328  7e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.917881  normal  0.0459006 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3981  TonB family protein  55.2 
 
 
296 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000313556 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2612  TonB family protein  41.05 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3022  TonB family protein  41.05 
 
 
304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.364821  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3055  TonB-like protein  38.81 
 
 
328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.719984  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2778  hypothetical protein  40.35 
 
 
304 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.241997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2856  TonB, C-terminal  39.86 
 
 
306 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  34.05 
 
 
296 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2576  TonB-like protein  33.7 
 
 
294 aa  138  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0854385 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0216  TonB family protein  35.23 
 
 
295 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  31.43 
 
 
307 aa  125  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  32.05 
 
 
316 aa  122  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0237  TonB family protein  32.2 
 
 
256 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  31.56 
 
 
292 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  30.11 
 
 
288 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  28.87 
 
 
300 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  28.87 
 
 
297 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  29.29 
 
 
294 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  29.01 
 
 
319 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  26.96 
 
 
298 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3091  TonB family protein  27.44 
 
 
294 aa  84  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.370908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0506  hypothetical protein  29.23 
 
 
297 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  26.4 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  26.4 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  26.58 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  25.34 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  28.63 
 
 
297 aa  79.3  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0891  TonB family protein  28.57 
 
 
291 aa  79  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.170067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1015  TonB protein  28.57 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  26.05 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  29.08 
 
 
299 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  26.41 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0537  TonB-like  27.56 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  29.22 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  35.71 
 
 
286 aa  75.9  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  25.82 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  26.44 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0510  TonB family protein  30.71 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  35.4 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01600  TonB protein  26.6 
 
 
291 aa  70.5  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2337  TonB-dependent receptor, putative  32.28 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  30.26 
 
 
297 aa  42.7  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2801  TonB family protein  25.26 
 
 
282 aa  42.7  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>