223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0737 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  100 
 
 
251 aa  480  1e-134  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  32.08 
 
 
256 aa  85.5  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  38 
 
 
495 aa  68.9  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1850  putative tonB protein  37.25 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.473086  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  39.08 
 
 
317 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0824  TonB family protein  34.44 
 
 
291 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0481121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  38.89 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2937  TonB family protein  35.64 
 
 
411 aa  61.2  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0451  TonB family protein  29.25 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103845  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  35 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  35 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  36.36 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  35 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  34.58 
 
 
507 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  35.06 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  29.84 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  41.67 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2822  TonB-like  41.43 
 
 
114 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.628558  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  33.33 
 
 
305 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  36.25 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  36.25 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  32.88 
 
 
244 aa  56.2  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  28.46 
 
 
233 aa  56.2  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  32.65 
 
 
243 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  32.65 
 
 
243 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  31.31 
 
 
292 aa  55.8  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  32.65 
 
 
243 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  37.88 
 
 
270 aa  55.5  0.0000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  30.4 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  33.73 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  37.8 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  34.48 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  34.07 
 
 
277 aa  54.7  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  39.29 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  32.97 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  33.33 
 
 
284 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  27.46 
 
 
336 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  38.75 
 
 
234 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  35.06 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  32.61 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  38.46 
 
 
349 aa  53.1  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  34.18 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1643  TonB family protein  32.65 
 
 
337 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0339167  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  28.26 
 
 
268 aa  53.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  32.14 
 
 
308 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1487  TonB family protein  35.96 
 
 
386 aa  52.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.39629 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  34.21 
 
 
268 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  34.21 
 
 
268 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  34.72 
 
 
266 aa  52.4  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  35.29 
 
 
280 aa  52.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  35.53 
 
 
258 aa  52  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  35.53 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1624  TonB-like  30.49 
 
 
285 aa  51.2  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0946322  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  37.5 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  33.66 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  33.33 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  33.33 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  33.33 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  31.51 
 
 
115 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  33.33 
 
 
207 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  31.87 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  35.53 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  37.1 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  33.33 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  34.67 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  33.8 
 
 
245 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  30.38 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  31.18 
 
 
220 aa  50.8  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  35.06 
 
 
285 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  25.19 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  42.19 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  30.12 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1922  TonB family protein  25.81 
 
 
208 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0923721  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  38.98 
 
 
417 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2275  TonB family protein  26.67 
 
 
242 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  32.53 
 
 
207 aa  49.7  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  32.41 
 
 
325 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  30 
 
 
324 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  28.74 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  32.14 
 
 
203 aa  49.3  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  29.17 
 
 
203 aa  49.3  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  38.67 
 
 
277 aa  49.7  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  35 
 
 
201 aa  49.3  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  33.77 
 
 
206 aa  49.7  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  37.25 
 
 
286 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  26.32 
 
 
249 aa  48.9  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  37.5 
 
 
334 aa  48.9  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  30.38 
 
 
236 aa  48.9  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  37.14 
 
 
206 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  37.14 
 
 
206 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  39.06 
 
 
206 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  37.14 
 
 
206 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  26.14 
 
 
251 aa  48.5  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  34.78 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  39.29 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  30.77 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  34.85 
 
 
278 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  36.07 
 
 
292 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  39.29 
 
 
371 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  26.06 
 
 
203 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>