65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0849 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  100 
 
 
249 aa  496  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  35.8 
 
 
257 aa  59.3  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  24.81 
 
 
241 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  28.29 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  28.69 
 
 
250 aa  55.8  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  37.36 
 
 
295 aa  55.5  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  31.4 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  23.48 
 
 
235 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  28.79 
 
 
227 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  35.29 
 
 
292 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  28.3 
 
 
261 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  27.03 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  25 
 
 
277 aa  49.3  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  22.67 
 
 
268 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  32.05 
 
 
245 aa  48.9  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  23.24 
 
 
268 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  30 
 
 
289 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  32.35 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  32.35 
 
 
226 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  42.59 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  19.91 
 
 
258 aa  48.5  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  32.35 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  29.89 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  31.75 
 
 
243 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  31.43 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  32.89 
 
 
308 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  29.85 
 
 
243 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  28.23 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  29.85 
 
 
226 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  29.85 
 
 
243 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  32.31 
 
 
246 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  32.31 
 
 
229 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  32.31 
 
 
246 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  32.31 
 
 
229 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  32.31 
 
 
246 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  32.31 
 
 
248 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  29.07 
 
 
244 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  32.31 
 
 
248 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  22.04 
 
 
268 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  25.81 
 
 
212 aa  45.4  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  35.06 
 
 
251 aa  45.4  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  35.85 
 
 
239 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  37.25 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0451  TonB family protein  32.1 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.103845  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  35.19 
 
 
267 aa  44.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  31.03 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  29.76 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  35.19 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  35.19 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  31.88 
 
 
475 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1845  TonB family protein  30.38 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  30.77 
 
 
252 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  36.11 
 
 
397 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  31.51 
 
 
227 aa  43.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0284  TonB family protein  27.38 
 
 
250 aa  42.7  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  20.7 
 
 
295 aa  42.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  22.54 
 
 
228 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  27.59 
 
 
292 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  27.91 
 
 
292 aa  42.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1850  putative tonB protein  29.89 
 
 
217 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.473086  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  30.67 
 
 
202 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  31.17 
 
 
283 aa  42.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  30.67 
 
 
164 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0878  TonB family protein  31.94 
 
 
248 aa  42  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  28.77 
 
 
245 aa  42  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>