140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1078 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  100 
 
 
245 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  81.63 
 
 
243 aa  340  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  82.02 
 
 
226 aa  321  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  82.86 
 
 
243 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  82.86 
 
 
243 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  83.77 
 
 
226 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  72.76 
 
 
243 aa  280  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  51.2 
 
 
248 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  48.98 
 
 
245 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  46.77 
 
 
246 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  46.77 
 
 
246 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  46.77 
 
 
246 aa  170  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  43.08 
 
 
248 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  47.19 
 
 
229 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  47.19 
 
 
229 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  47.11 
 
 
244 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  48.67 
 
 
244 aa  148  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  45.65 
 
 
245 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  58.24 
 
 
230 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  40.51 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  45.45 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  36.17 
 
 
236 aa  72  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  41.56 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  44 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  36.17 
 
 
256 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  40.26 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  42.7 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  40 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  36.46 
 
 
221 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  32.9 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1792  TonB family protein  34.67 
 
 
218 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.433494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  40.76 
 
 
233 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2116  TonB family protein  40.45 
 
 
218 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223061  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  32.19 
 
 
234 aa  62  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  31.85 
 
 
287 aa  62  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  31.89 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  31.89 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  45.31 
 
 
224 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  37.09 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  40.24 
 
 
441 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  37.09 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6109  TonB family protein  33.2 
 
 
262 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  31.3 
 
 
230 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  41.03 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  39.24 
 
 
238 aa  59.3  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  32.85 
 
 
237 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  34.44 
 
 
193 aa  58.9  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  29.73 
 
 
288 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  36.71 
 
 
280 aa  57.4  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  35.11 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  38.46 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  32.5 
 
 
269 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  38.46 
 
 
234 aa  56.6  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  42.86 
 
 
232 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  33.75 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  37.18 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  30.41 
 
 
295 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  37.18 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  41.33 
 
 
212 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  30.18 
 
 
212 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  37.33 
 
 
285 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  38.46 
 
 
317 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  33.73 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  37.67 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  29.33 
 
 
251 aa  52.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  41.77 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  41.77 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  34.44 
 
 
255 aa  52  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  28.19 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  35.06 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  34.62 
 
 
285 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  39.73 
 
 
117 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  28.14 
 
 
248 aa  50.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  32.91 
 
 
319 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  30.13 
 
 
201 aa  49.3  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  19.73 
 
 
256 aa  48.9  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  38.46 
 
 
271 aa  48.9  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  36 
 
 
273 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  40.74 
 
 
228 aa  48.5  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  37.18 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  35.8 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  31.87 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  37.36 
 
 
1281 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  27.67 
 
 
248 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  27.68 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  38.89 
 
 
1482 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  36.67 
 
 
289 aa  46.6  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  42.86 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  28.57 
 
 
283 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  42.31 
 
 
291 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  42.86 
 
 
308 aa  46.6  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0761  TonB family protein  45.28 
 
 
247 aa  45.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.988659  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  48.98 
 
 
284 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  32.97 
 
 
275 aa  45.8  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  26.7 
 
 
268 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  34.62 
 
 
231 aa  45.4  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  44.68 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  24.53 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  32.26 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  34.62 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>