87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3718 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  100 
 
 		 238 aa  443  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  46.59 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  40.91 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  33.18 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  42.86 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  37.04 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  34.59 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  36.14 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  37.75 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  43.68 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  33.54 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  47.44 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  41.25 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  34.87 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  41.25 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  41.25 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  41.25 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  41.25 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  41.67 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  40 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  45.33 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  40.48 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  32.98 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  39.47 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  47.76 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  39.47 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  40 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  40 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  36.05 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  35.53 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  45 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  38.64 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  45 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  38.96 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  38.1 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  45 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  45 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  45 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  45 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  45 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  33.59 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  34.21 
 
 		 289 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  37.84 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  36.84 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1571  TonB family protein  58 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.265243 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  45 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  40.79 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  32.91 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  35.06 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1792  TonB family protein  34.74 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.433494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  38.36 
 
 		 117 aa  52  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2116  TonB family protein  34.74 
 
 		 218 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  36.36 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  37.66 
 
 		 293 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  35.71 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  45.45 
 
 		 231 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  45.45 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  35.11 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  31.36 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  31.36 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  34.52 
 
 		 475 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1514  TonB family protein  29.9 
 
 		 331 aa  48.5  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.27 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  35.06 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  33.77 
 
 		 390 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  27.33 
 
 		 274 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  34.78 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  32 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  35.23 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  33.33 
 
 		 225 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  32.26 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  25.64 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  39.06 
 
 		 140 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  35.06 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  35.23 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  31.17 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  30.26 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  30.32 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  29.41 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  30.26 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  32.41 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  30.36 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  26.67 
 
 		 270 aa  43.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  34.52 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  32.47 
 
 		 242 aa  42.7  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  34.43 
 
 		 218 aa  42.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  27.27 
 
 		 259 aa  41.6  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>