50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1514 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1514  TonB family protein  100 
 
 
331 aa  630  1e-179  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1664  TonB/TolA energy transducing protein  37.1 
 
 
337 aa  134  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0106366  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1906  TonB-like  34.68 
 
 
334 aa  112  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.338738  normal  0.207358 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0777  TonB family protein  40.43 
 
 
141 aa  83.2  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.114118  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1247  TonB-like  35.05 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.406253 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  52.87 
 
 
489 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  52.87 
 
 
484 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  53.01 
 
 
444 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  48.72 
 
 
453 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  35.29 
 
 
244 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  35.29 
 
 
244 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0964  glycosyl transferase family protein  44.64 
 
 
488 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.824604  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  28.7 
 
 
288 aa  50.1  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  28.7 
 
 
287 aa  49.7  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  35.9 
 
 
184 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3227  hypothetical protein  43.4 
 
 
996 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.640032  normal  0.507723 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  32.26 
 
 
267 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  34.29 
 
 
221 aa  47.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  34.62 
 
 
280 aa  47  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  36.76 
 
 
231 aa  47  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  36.23 
 
 
231 aa  46.6  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  34.29 
 
 
221 aa  46.2  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  35.86 
 
 
268 aa  46.2  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1012  hypothetical protein  55 
 
 
432 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217202  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  34.92 
 
 
275 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  31.88 
 
 
212 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  42.86 
 
 
112 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  37.5 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  34.94 
 
 
233 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  38.61 
 
 
1261 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  37.5 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  33.8 
 
 
190 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  27.52 
 
 
248 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  34.92 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  32.39 
 
 
285 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  33.7 
 
 
238 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  36.51 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  34.92 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  32.88 
 
 
219 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  36.51 
 
 
264 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  49.4 
 
 
423 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  35.06 
 
 
273 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  38.16 
 
 
928 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  26.89 
 
 
267 aa  43.1  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0936  hypothetical protein  51.52 
 
 
801 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  26.89 
 
 
267 aa  43.1  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  26.89 
 
 
267 aa  43.1  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  36.51 
 
 
251 aa  42.7  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3278  hypothetical protein  58.33 
 
 
966 aa  42.4  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>