163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2085 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  100 
 
 		 319 aa  627  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  57.43 
 
 		 225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  43.62 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  35.23 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  44.68 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  32.97 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  40.45 
 
 		 237 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  33.1 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  38.96 
 
 		 193 aa  70.5  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  34.62 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  34.78 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  37.5 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  40 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  35.05 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  38.64 
 
 		 134 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  37.08 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  37.66 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  40.26 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  40.26 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  35.9 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  35.06 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  36.36 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  36.36 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  30.15 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  35.9 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  36.36 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  28.39 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  27.86 
 
 		 206 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.87 
 
 		 459 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  27.4 
 
 		 227 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  37.23 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  33.77 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  34.33 
 
 		 206 aa  53.9  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  34.13 
 
 		 413 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  33.33 
 
 		 253 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  33.77 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  33.33 
 
 		 121 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  34.18 
 
 		 242 aa  53.5  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  33.06 
 
 		 447 aa  53.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  26.34 
 
 		 301 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  34.88 
 
 		 285 aa  53.1  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  38.46 
 
 		 223 aa  52.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  32.47 
 
 		 273 aa  53.1  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  35.06 
 
 		 270 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  32.84 
 
 		 207 aa  52.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  35.06 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  34.18 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  31.82 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  29.06 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  37.21 
 
 		 269 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2087  TonB family protein  33.73 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.000490312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  34.62 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  31.03 
 
 		 273 aa  50.8  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  36 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  31.46 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  35.56 
 
 		 441 aa  50.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  31.91 
 
 		 258 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  28.04 
 
 		 668 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  32.47 
 
 		 274 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  33.33 
 
 		 288 aa  49.3  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  28.04 
 
 		 276 aa  49.7  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  32.71 
 
 		 239 aa  49.3  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  39.39 
 
 		 202 aa  49.3  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  31.65 
 
 		 217 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  29.67 
 
 		 255 aa  48.9  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  28.57 
 
 		 275 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  31.82 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  27.82 
 
 		 206 aa  48.9  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  36.25 
 
 		 117 aa  48.5  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  32.91 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  31.17 
 
 		 221 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  31.17 
 
 		 221 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  33.33 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  33.33 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  31.17 
 
 		 273 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  29.03 
 
 		 228 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  33.33 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  33.33 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  35.53 
 
 		 467 aa  48.5  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  33.33 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  34.62 
 
 		 244 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  31.65 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  35.21 
 
 		 238 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  29.49 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  32.05 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  33.33 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  33.33 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  38.46 
 
 		 266 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  33.33 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  33.33 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  31.17 
 
 		 184 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  34.67 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  32.84 
 
 		 206 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  28 
 
 		 582 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  29.89 
 
 		 210 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  30 
 
 		 223 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  32.26 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  31.65 
 
 		 226 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  33.72 
 
 		 565 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>