48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2087 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2087  TonB family protein  100 
 
 		 219 aa  430  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.000490312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0381  TonB protein  58 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0825202 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  38.24 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  38.24 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1440  TonB family protein  35.58 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  38.24 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  36.36 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  33 
 
 		 232 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7326  TonB-like protein  33.15 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  42 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  25.49 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  34.78 
 
 		 467 aa  52.8  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  30.26 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3235  TonB family protein  38.6 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  33.73 
 
 		 319 aa  52  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  42.62 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  28.07 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  30.34 
 
 		 203 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  30.34 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  30.34 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1935  hypothetical protein  39.62 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.236063 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  30.34 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  29.59 
 
 		 275 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  29.87 
 
 		 349 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  25 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  29.01 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  34.02 
 
 		 447 aa  46.2  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1758  hypothetical protein  35.19 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.322377 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  29.21 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  31.48 
 
 		 2449 aa  45.4  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  31.25 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  26.97 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  31.65 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  30.95 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  24.04 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  25.29 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4356  TonB-like protein  47.27 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  32.8 
 
 		 441 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  31.3 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  31.17 
 
 		 225 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  31.75 
 
 		 138 aa  42.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  30.1 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  36.47 
 
 		 117 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  26.79 
 
 		 270 aa  42  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  26.86 
 
 		 249 aa  42  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  22.49 
 
 		 207 aa  42  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  29.52 
 
 		 252 aa  42  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  30.23 
 
 		 392 aa  41.6  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>