146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2344 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  100 
 
 		 220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  36.12 
 
 		 459 aa  136  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  43.02 
 
 		 565 aa  82.4  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  42.55 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  46.51 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  36 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  39.02 
 
 		 112 aa  74.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  39.33 
 
 		 121 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  34.43 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  39.33 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  39.81 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  35.07 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  37.23 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  38.95 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  40.79 
 
 		 258 aa  64.7  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  37.5 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  41.03 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  41.03 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  38.67 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  31.96 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  38.46 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1010  TonB family protein  38.78 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0128587 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  39.24 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  44.19 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  44.19 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1782  TonB family protein  34.58 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  32.5 
 
 		 270 aa  58.2  0.00000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  37.04 
 
 		 700 aa  57  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  38.67 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  32.29 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  38.55 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  46.27 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.07 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  34.74 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  39.47 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  39.29 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  31.94 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  31.11 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  34.52 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  35.14 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  38.46 
 
 		 368 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  34.62 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  33.77 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  27.93 
 
 		 405 aa  52  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  38.1 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  35.9 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  26.72 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4696  TonB family protein  41.18 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  35 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  38.1 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  38.37 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4100  TonB family protein  34.09 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.694264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  35 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  33.8 
 
 		 349 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  33.33 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  33.33 
 
 		 301 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  42.62 
 
 		 340 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  34.21 
 
 		 276 aa  48.9  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  29.63 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  34.18 
 
 		 274 aa  48.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  32.93 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  35.06 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  34.62 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  34.62 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  37.21 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  30.95 
 
 		 332 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  35.9 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  33.77 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  32.93 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  34.18 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5449  TonB-like  31.25 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5008  TonB-like protein  33.73 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.106171 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  35.53 
 
 		 285 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  31.65 
 
 		 137 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  35.9 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  34.62 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  27.87 
 
 		 467 aa  46.6  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6361  TonB-like  34.21 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0284134  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  32.93 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  32.93 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1717  TonB family protein  34.21 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  34.62 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  32.93 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  28.85 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  31.71 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1732  TonB family protein  34.21 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976014  normal  0.423911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  35.14 
 
 		 363 aa  45.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  31.65 
 
 		 137 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  32.89 
 
 		 253 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  28.57 
 
 		 255 aa  45.4  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  26.92 
 
 		 369 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  32.93 
 
 		 203 aa  45.1  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  28.09 
 
 		 369 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  35.37 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  33.77 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3000  TonB protein  36.47 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  30.26 
 
 		 614 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  29.67 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  26.92 
 
 		 370 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  31.25 
 
 		 305 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>