138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1862 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  100 
 
 		 332 aa  660    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3085  TonB-like protein  57.14 
 
 		 298 aa  180  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.477938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3133  TonB-like protein  68.34 
 
 		 342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  43.59 
 
 		 150 aa  92.8  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  31.61 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0560  TonB-like protein  36.05 
 
 		 352 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000337767  normal  0.21091 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  40.23 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  40.23 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  39.13 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  40.48 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  42.67 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  42.68 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  42.68 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  38.53 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  40.24 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  40.24 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  38.96 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  37.33 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  38.27 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  37.8 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  34.15 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  35.87 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  38.67 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  40 
 
 		 668 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  39.51 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  39.02 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  30.12 
 
 		 582 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  41.56 
 
 		 117 aa  57  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  39.51 
 
 		 137 aa  57  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  37.8 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  39.19 
 
 		 447 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  31.11 
 
 		 604 aa  54.7  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  38.27 
 
 		 137 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  36.59 
 
 		 270 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  34 
 
 		 390 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  36.47 
 
 		 253 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  40.26 
 
 		 221 aa  53.1  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  34.15 
 
 		 253 aa  53.5  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  35.37 
 
 		 275 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  40.26 
 
 		 221 aa  53.1  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  31.11 
 
 		 565 aa  53.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  36.59 
 
 		 264 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  40.24 
 
 		 244 aa  52.8  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  42.03 
 
 		 271 aa  52.8  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  35.44 
 
 		 237 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  38.16 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  32.99 
 
 		 249 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  38.67 
 
 		 221 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  33.7 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  32.35 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  29.41 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  34.52 
 
 		 212 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  34.07 
 
 		 273 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  37.5 
 
 		 280 aa  50.8  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  32.26 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  31.46 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  30.69 
 
 		 220 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1508  TonB family protein  40.66 
 
 		 859 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0174909  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  38.36 
 
 		 156 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  32.53 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  36.59 
 
 		 273 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  32.93 
 
 		 259 aa  50.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  39.74 
 
 		 208 aa  50.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  31.18 
 
 		 484 aa  49.7  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  29.03 
 
 		 249 aa  50.1  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  40 
 
 		 860 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  34.07 
 
 		 274 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  23.48 
 
 		 259 aa  49.7  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  35.37 
 
 		 287 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  34.88 
 
 		 212 aa  49.7  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  32.93 
 
 		 286 aa  49.7  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  32.93 
 
 		 274 aa  49.7  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  32.93 
 
 		 276 aa  49.3  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  32.93 
 
 		 275 aa  49.7  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  34.69 
 
 		 210 aa  49.3  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  31.08 
 
 		 121 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  32.97 
 
 		 413 aa  49.3  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  35.37 
 
 		 288 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  36.59 
 
 		 266 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  32.63 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  36.59 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  33.33 
 
 		 134 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  34.57 
 
 		 138 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  40.62 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0897  TonB protein  31.03 
 
 		 241 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  33.33 
 
 		 506 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4592  TonB family protein  29.89 
 
 		 227 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  31.11 
 
 		 275 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  29.49 
 
 		 205 aa  47.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0870  TonB family protein  35.29 
 
 		 865 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.306843  normal  0.658242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  31.11 
 
 		 804 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  32.93 
 
 		 228 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  30.53 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  30.49 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  28.83 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  35.82 
 
 		 267 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  33.33 
 
 		 271 aa  47.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  28.24 
 
 		 237 aa  47  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  29.65 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  30.34 
 
 		 267 aa  47  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>