156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0245 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  100 
 
 		 255 aa  523  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  51.69 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  44.58 
 
 		 582 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3657  hypothetical protein  34.57 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  38.82 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  39.08 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  41.11 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4364  hypothetical protein  47.37 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  32.94 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1218  TonB-like protein  34.52 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0834561  normal  0.166487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3878  TonB-like protein  40.54 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.781736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  34.74 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  36.25 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  34.74 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  30.21 
 
 		 112 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0038  TonB-like protein  32.38 
 
 		 362 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  34.41 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  33.33 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  34.74 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  33.68 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  28.23 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  34.15 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  33.68 
 
 		 203 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  33.68 
 
 		 203 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  35.06 
 
 		 270 aa  53.5  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  38.16 
 
 		 332 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  37.08 
 
 		 232 aa  53.9  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  32.53 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  28.57 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  34.44 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  30.19 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  33.33 
 
 		 217 aa  52.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  26.37 
 
 		 369 aa  52  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  30.4 
 
 		 215 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  32.94 
 
 		 392 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  34.83 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  32.26 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  34.83 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  34.44 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  35.56 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  36.71 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  36.71 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  36.71 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  26.37 
 
 		 368 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  30.49 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  34.09 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  37.18 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  37.18 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  30.49 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  37.18 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  36.25 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  37.18 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  34.09 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  30.49 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  36.36 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  30.49 
 
 		 206 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  28.95 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  29.06 
 
 		 225 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  26.14 
 
 		 363 aa  48.9  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  34.62 
 
 		 117 aa  48.9  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  27.78 
 
 		 404 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  30.95 
 
 		 287 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1775  TonB-like protein  32.76 
 
 		 122 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  33.71 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  26.83 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  26.83 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  33.71 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  28.05 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  35 
 
 		 390 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  34.09 
 
 		 234 aa  48.5  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  33.71 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  28.05 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  31.46 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  27.08 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  29.27 
 
 		 134 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  36.59 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  30.38 
 
 		 614 aa  47.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  38.1 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  25.88 
 
 		 371 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  25.88 
 
 		 371 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  27.85 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  25 
 
 		 370 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  27.87 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  26.92 
 
 		 369 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  31.46 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  35 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  31.17 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  26.92 
 
 		 370 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2101  TonB-like protein  36.36 
 
 		 487 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  29.52 
 
 		 357 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  41.89 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  27.78 
 
 		 700 aa  46.6  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  32.47 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  33.33 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  36.71 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  25 
 
 		 371 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  30.23 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  31.4 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  32.05 
 
 		 413 aa  46.2  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  30.95 
 
 		 288 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>