233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2863 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  100 
 
 		 390 aa  780    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  48.42 
 
 		 277 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  43.62 
 
 		 219 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  28.89 
 
 		 259 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  43.62 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  37.89 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  50.59 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  38 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  40.66 
 
 		 275 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  35.92 
 
 		 289 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  40.22 
 
 		 237 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  44.16 
 
 		 234 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  45.45 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  43.59 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  40.26 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  40.51 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  39.33 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  45.57 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  43.82 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  40.26 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  40.26 
 
 		 248 aa  69.3  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  42.86 
 
 		 232 aa  68.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  35.11 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  44.16 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  40.26 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  44.16 
 
 		 244 aa  68.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  40.26 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  45.45 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  34.23 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  29.92 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  32.2 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  37.08 
 
 		 249 aa  67  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  38.38 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  40 
 
 		 223 aa  65.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  43.75 
 
 		 280 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  44.16 
 
 		 117 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  37.93 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  43.59 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  38.14 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  42.05 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  39.56 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  44.16 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  41.05 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  41.57 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  44.16 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  35.96 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  40.26 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  39.24 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  42.31 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  38.04 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  41.56 
 
 		 270 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  36.36 
 
 		 250 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  36.36 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  37.08 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  32.97 
 
 		 112 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  43.59 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  41.56 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  38.82 
 
 		 134 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  33 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  45.45 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  34.12 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  34.07 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  35.44 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  31.3 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  34.07 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  43.04 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  34.07 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  34.07 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  34.78 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  37.66 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  38.96 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  44.26 
 
 		 274 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  37.18 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  37.18 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  33.33 
 
 		 207 aa  59.3  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  39.74 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  35.53 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  34.18 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  39.08 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  38.96 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  38.16 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  38.96 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  36.22 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  35.53 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  31.3 
 
 		 202 aa  58.9  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  37.66 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  37.66 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  37.66 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  33.33 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  33.33 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  42.31 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  34.21 
 
 		 207 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  34.21 
 
 		 207 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  41.79 
 
 		 202 aa  57  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  42.37 
 
 		 115 aa  57  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  35.53 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  44.26 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  35.44 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  38.46 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  38.96 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>