176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1020 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  100 
 
 
275 aa  527  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  100 
 
 
275 aa  527  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  48.28 
 
 
233 aa  89.7  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  48.28 
 
 
233 aa  89.4  6e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  45.98 
 
 
234 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  42.53 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  33.13 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  44.83 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  39.32 
 
 
244 aa  82  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  39.32 
 
 
244 aa  82  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  32.9 
 
 
212 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  45.24 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  30.8 
 
 
248 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  39.56 
 
 
269 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  41.67 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  44.16 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  44.16 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  43.04 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  41.38 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  44.16 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  44.16 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  44.16 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  44.16 
 
 
246 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  41.38 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  44.16 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  41.77 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  41.77 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  39.51 
 
 
223 aa  72  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  38.89 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  44.83 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  39.29 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  39.29 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  39.24 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  42.86 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  39.24 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  39.24 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  39.24 
 
 
243 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  39.24 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  40 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  38.37 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  32.97 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  38.82 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  40.51 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  34.52 
 
 
248 aa  68.2  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  30 
 
 
287 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  38.96 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  40.26 
 
 
244 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  40.51 
 
 
244 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  34.83 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  34.83 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  33.33 
 
 
242 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  33.33 
 
 
242 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  34.83 
 
 
273 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  36.36 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  37.5 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  36.9 
 
 
277 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  36.9 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  35.29 
 
 
275 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  30.51 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  32.95 
 
 
288 aa  63.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  34.38 
 
 
267 aa  63.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  37.18 
 
 
390 aa  63.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  37.18 
 
 
221 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  41.56 
 
 
245 aa  62.4  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  37.18 
 
 
233 aa  62.4  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  33.33 
 
 
274 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  33.33 
 
 
286 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  33.33 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  40 
 
 
219 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  36.71 
 
 
231 aa  61.2  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  36.71 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  30.38 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  41.03 
 
 
208 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  35.37 
 
 
117 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  40.26 
 
 
236 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  33.33 
 
 
225 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  40 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  40 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  50.88 
 
 
228 aa  57.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  33.73 
 
 
308 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  37.66 
 
 
285 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  29.92 
 
 
283 aa  55.8  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  38.67 
 
 
219 aa  55.8  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  38.67 
 
 
219 aa  55.8  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  32.46 
 
 
112 aa  55.8  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  33.71 
 
 
273 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  42.86 
 
 
218 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  37.33 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  25.96 
 
 
219 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  30.11 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  32.91 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  31.03 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  32.58 
 
 
274 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  28.81 
 
 
212 aa  53.5  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  28.57 
 
 
220 aa  53.1  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2116  TonB family protein  38.46 
 
 
218 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223061  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1792  TonB family protein  38.46 
 
 
218 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.433494 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  38.96 
 
 
221 aa  52.4  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1514  TonB family protein  31.58 
 
 
331 aa  52.8  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  41.67 
 
 
224 aa  52.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>