123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1409 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  100 
 
 		 244 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  89.8 
 
 		 245 aa  333  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  49.6 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  47.24 
 
 		 243 aa  178  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  47.66 
 
 		 226 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  49.8 
 
 		 248 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  49.8 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  49.8 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  49.8 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  46.96 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  52.38 
 
 		 243 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  51.3 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  51.3 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  50 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  50 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  49.19 
 
 		 245 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  52.68 
 
 		 244 aa  154  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  50 
 
 		 226 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  53.85 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  46.15 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  43.18 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  31.68 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  38.95 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  41.86 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  37.5 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  41.86 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  44.87 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  43.18 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  43.59 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  42.22 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  35.06 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  35.06 
 
 		 244 aa  65.9  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  41.77 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  37.66 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  43.04 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  34.18 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  41.98 
 
 		 441 aa  62  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  44.44 
 
 		 208 aa  62  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  32.27 
 
 		 212 aa  62  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  31.58 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  38.46 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  47.76 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  29.88 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  38.46 
 
 		 244 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  31.72 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1792  TonB family protein  44.16 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.433494 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  44.62 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  35.44 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2116  TonB family protein  44.16 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  32.85 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  27.48 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  43.28 
 
 		 280 aa  55.5  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  33.33 
 
 		 269 aa  55.5  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6109  TonB family protein  38.54 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  29.85 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0965  TonB family protein  37.8 
 
 		 283 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  39.39 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  40.51 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  40.51 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  47.69 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  37.8 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  42.42 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  36.71 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  28.45 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  37.5 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  28.45 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  38.81 
 
 		 349 aa  52.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  45.61 
 
 		 277 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  28.43 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  40.35 
 
 		 276 aa  52  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  38.96 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  30.3 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  39.02 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  34.62 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  36.71 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  48.28 
 
 		 285 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  45.1 
 
 		 295 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  42.19 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  34.18 
 
 		 319 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  41.77 
 
 		 231 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  41.77 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  37.04 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  39.53 
 
 		 1281 aa  49.7  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  29.81 
 
 		 193 aa  48.9  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  37.8 
 
 		 290 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  46 
 
 		 316 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  37.8 
 
 		 295 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  29.33 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1053  TonB family protein  37.8 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0250994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  42.11 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  42.11 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  37.8 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  34.29 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  33.33 
 
 		 308 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0761  TonB family protein  38.33 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.988659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  36.59 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  40.62 
 
 		 117 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  36.84 
 
 		 300 aa  46.6  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  41.25 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  32.56 
 
 		 246 aa  45.8  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>