129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1512 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  100 
 
 		 316 aa  627  1e-179  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  43.82 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  42.86 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  28.22 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  45.56 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  29.28 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  33.71 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  40.45 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1368  TonB family protein  34.78 
 
 		 277 aa  67  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  34.33 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  46.48 
 
 		 164 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  46.48 
 
 		 202 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  35.48 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  34.21 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  33.33 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  30.71 
 
 		 264 aa  62.4  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0730  TonB-like  37.89 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.210175  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  30.84 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2668  TonB family protein  34.17 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  38.04 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  26.32 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  39.29 
 
 		 201 aa  58.9  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  34.82 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  33.33 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  30.84 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  42.22 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  25.84 
 
 		 268 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2278  TonB family protein  31.15 
 
 		 247 aa  57  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  30.62 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  36.71 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  34.88 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  34.94 
 
 		 227 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  36.78 
 
 		 242 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  36.78 
 
 		 242 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  38.27 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  31.01 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  51.92 
 
 		 441 aa  53.5  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  28.65 
 
 		 292 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  45.28 
 
 		 228 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  30.33 
 
 		 268 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3266  TonB family protein  33.93 
 
 		 451 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0913504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  30.33 
 
 		 268 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3636  hypothetical protein  38.2 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0466  TonB domain protein  27.36 
 
 		 217 aa  52.4  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  28.04 
 
 		 295 aa  52.4  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  34.51 
 
 		 245 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  34.12 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  36.99 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  34.15 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  36.49 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  38.36 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  43.08 
 
 		 244 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  43.1 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  35.9 
 
 		 475 aa  50.4  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  35.71 
 
 		 495 aa  50.1  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  30 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  37.8 
 
 		 215 aa  49.7  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  26.62 
 
 		 292 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  33.71 
 
 		 289 aa  49.3  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2507  TonB-like protein  39.06 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  34.92 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  26.42 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5310  TonB-like  34.88 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0148466  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5125  TonB family protein  32.43 
 
 		 263 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  40 
 
 		 245 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3679  TonB family protein  43.1 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  37.33 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5036  tonB domain protein  34.52 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  34.92 
 
 		 248 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  34.52 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0624  hypothetical protein  30.63 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  46.67 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0350  TonB family protein  38.98 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.650813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  46 
 
 		 284 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0937  TonB family protein  37.7 
 
 		 288 aa  47.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.164985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  39.13 
 
 		 300 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  31.33 
 
 		 237 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0588  TonB-like  30.63 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  26.73 
 
 		 227 aa  47  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4868  TonB family protein  39.13 
 
 		 301 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0170221 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4324  TonB family protein  34.83 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  32.56 
 
 		 285 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4994  TonB family protein  39.13 
 
 		 301 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.416898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  36.59 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  39.13 
 
 		 301 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  34.48 
 
 		 251 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7000  hypothetical protein  35.58 
 
 		 154 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695854 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  33.7 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  30.5 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05300  TonB domain-containing protein  30.95 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  36.36 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  35.06 
 
 		 269 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  42.86 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  35.71 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  35.62 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  29.73 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  29.73 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  33.64 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  30.12 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  40.35 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>