96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2475 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2475  TonB like protein  100 
 
 		 230 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.672358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  59.78 
 
 		 243 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  59.78 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2198  TonB family protein  59.78 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5879  TonB-like  59.78 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2223  TonB family protein  59.78 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0534609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  58.7 
 
 		 245 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  55.43 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  54.35 
 
 		 245 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  54.35 
 
 		 244 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  51.33 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  55.43 
 
 		 248 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  55.43 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  55.43 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  55.43 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  55.43 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  55.43 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  55.43 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  46.74 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  40.91 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1149  TonB family protein  41.67 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  42.86 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  33.33 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  40 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  36.84 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  33.33 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  31.91 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1792  TonB family protein  39.08 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.433494 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2116  TonB family protein  39.08 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  37.66 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  40.85 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  50 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  45.31 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  39.24 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  37.33 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  32.28 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  31.39 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  40.62 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  36.71 
 
 		 233 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  34.75 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  36.71 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6109  TonB family protein  33.02 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  34.75 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  36.71 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  40 
 
 		 285 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  39.06 
 
 		 259 aa  53.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  36.25 
 
 		 280 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  38.81 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  28.83 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  31.48 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  42.86 
 
 		 277 aa  52  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  42.86 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  42.86 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  34.67 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  35.37 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  34.57 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  34.57 
 
 		 441 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  37.86 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  34.83 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  33.33 
 
 		 244 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  33.33 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  39.58 
 
 		 267 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  34.15 
 
 		 253 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  31.08 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  28.57 
 
 		 258 aa  45.1  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  39.58 
 
 		 267 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  39.58 
 
 		 267 aa  45.4  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  36.67 
 
 		 289 aa  45.1  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0761  TonB family protein  38.33 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.988659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  43.86 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2405  TonB family protein  34.25 
 
 		 310 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  36.36 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  29.63 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  37.04 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  32.26 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1247  TonB-like  27.16 
 
 		 338 aa  45.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.406253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  36.25 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  37.1 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  40 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5982  tonB protein  36.73 
 
 		 317 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  39.39 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  29.03 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  30.43 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  33.73 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  32.67 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  33.73 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  33.33 
 
 		 289 aa  42.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  34.85 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  28.19 
 
 		 249 aa  42.4  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  34.85 
 
 		 275 aa  42.4  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  32 
 
 		 268 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0897  TonB protein  28.57 
 
 		 241 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  28.22 
 
 		 237 aa  42  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  32.74 
 
 		 244 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  32 
 
 		 249 aa  42  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  37.5 
 
 		 283 aa  41.6  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>