227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2536 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  100 
 
 
212 aa  415  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  54.75 
 
 
219 aa  171  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  54.75 
 
 
219 aa  171  5.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  39.45 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  38.99 
 
 
231 aa  127  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  44.35 
 
 
244 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  44.35 
 
 
244 aa  87  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  43.01 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  46.02 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  48.68 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  47.37 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  47.37 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  45.12 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  46.25 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  48.75 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  47.56 
 
 
286 aa  75.1  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  46.25 
 
 
264 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  47.56 
 
 
274 aa  75.1  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  43.04 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  43.9 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  43.9 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  32.17 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  47.5 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  47.5 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  47.5 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  43.59 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  50 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  44.05 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  44.05 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  42.5 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  45.12 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  47.37 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  41.46 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  41.25 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  41.25 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  46.25 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  43.75 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  43.04 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  40.87 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  39.29 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  40.35 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  42.17 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  39.51 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  42.17 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  45.45 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  43.04 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  41.77 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  40 
 
 
276 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  40.96 
 
 
219 aa  65.1  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  43.59 
 
 
234 aa  64.7  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  31.47 
 
 
218 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  36.59 
 
 
248 aa  63.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  41.98 
 
 
289 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  33.7 
 
 
413 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  40.26 
 
 
234 aa  62.8  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  40.26 
 
 
230 aa  62.4  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  43.9 
 
 
264 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  37.5 
 
 
138 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  40.74 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  44.87 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  36.84 
 
 
243 aa  60.5  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  26.78 
 
 
249 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  37.97 
 
 
273 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  38.16 
 
 
390 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  36.21 
 
 
441 aa  58.5  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  37.5 
 
 
228 aa  58.2  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  37.97 
 
 
274 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  38.75 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  31.9 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  36.56 
 
 
245 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  42.27 
 
 
117 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  29.75 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  42.68 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  32.5 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  28.92 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  35.87 
 
 
371 aa  57  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  30.7 
 
 
202 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  39.24 
 
 
285 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  29.29 
 
 
112 aa  56.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  31.58 
 
 
206 aa  55.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  40.54 
 
 
248 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  41.33 
 
 
245 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  37.66 
 
 
203 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  44.74 
 
 
228 aa  55.1  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  45 
 
 
334 aa  55.1  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  37.8 
 
 
229 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  37.8 
 
 
229 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  38.57 
 
 
443 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  41.33 
 
 
238 aa  55.1  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  37.66 
 
 
203 aa  55.1  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  37.8 
 
 
246 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  37.8 
 
 
246 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  37.8 
 
 
248 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  37.8 
 
 
246 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  41.33 
 
 
245 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  29.33 
 
 
369 aa  54.7  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  33.33 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  38.67 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  40.54 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  32.47 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>