91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2420 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  100 
 
 
443 aa  839    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  31.58 
 
 
507 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3033  TonB family protein  31.67 
 
 
528 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3088  TonB family protein  31.67 
 
 
528 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0726849  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  31.97 
 
 
2449 aa  60.1  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  35.63 
 
 
234 aa  57.4  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  45.28 
 
 
289 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  35.06 
 
 
287 aa  57  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  41.67 
 
 
221 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  37.18 
 
 
285 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  44.07 
 
 
260 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  35.06 
 
 
288 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  34.57 
 
 
218 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  36.14 
 
 
417 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  41.67 
 
 
221 aa  55.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  40.35 
 
 
249 aa  54.3  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  31.17 
 
 
251 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  40.62 
 
 
184 aa  53.9  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  38.96 
 
 
273 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  29.46 
 
 
242 aa  53.5  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  29.46 
 
 
242 aa  53.5  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  27.8 
 
 
292 aa  53.5  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  37.25 
 
 
467 aa  53.1  0.000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  31.17 
 
 
252 aa  53.1  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  31.58 
 
 
249 aa  52.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0008  TonB family protein  47.27 
 
 
222 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  35.14 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  32.5 
 
 
243 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  28.41 
 
 
252 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  38.96 
 
 
274 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  38.75 
 
 
280 aa  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  38.57 
 
 
212 aa  52.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  32.43 
 
 
256 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  32.43 
 
 
256 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  32.43 
 
 
252 aa  51.2  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  34.55 
 
 
115 aa  50.4  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  33.33 
 
 
238 aa  50.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3236  TonB family protein  37.5 
 
 
291 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00481831  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  31.65 
 
 
237 aa  50.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  36.49 
 
 
397 aa  50.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  35.14 
 
 
308 aa  50.1  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  39.68 
 
 
244 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  39.68 
 
 
244 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  28.1 
 
 
405 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  35.06 
 
 
274 aa  49.3  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  35.06 
 
 
275 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  35.06 
 
 
286 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  33.72 
 
 
336 aa  48.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  36.51 
 
 
138 aa  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  37.29 
 
 
285 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  29.49 
 
 
240 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  29.49 
 
 
242 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  29.49 
 
 
242 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  40.96 
 
 
228 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  29.49 
 
 
242 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  38.33 
 
 
231 aa  47.8  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  37.68 
 
 
137 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  38.33 
 
 
231 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0339  TonB family protein  30 
 
 
597 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  33.78 
 
 
403 aa  47.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  40.98 
 
 
276 aa  47  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  34.21 
 
 
193 aa  47  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  30.86 
 
 
228 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  28.21 
 
 
240 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  37.04 
 
 
275 aa  47  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3111  TonB, C-terminal  42.86 
 
 
174 aa  46.6  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  29.55 
 
 
256 aa  45.8  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  32.05 
 
 
277 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  30.67 
 
 
246 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  38.55 
 
 
228 aa  46.2  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  29.49 
 
 
215 aa  45.8  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  33.78 
 
 
266 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  32.31 
 
 
248 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  47.62 
 
 
250 aa  45.8  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  27.85 
 
 
253 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  34.18 
 
 
264 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  32.47 
 
 
270 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  33.78 
 
 
266 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  32.05 
 
 
273 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.28 
 
 
1888 aa  44.3  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  35 
 
 
300 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  33.77 
 
 
273 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  36.51 
 
 
259 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  40 
 
 
284 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  35.06 
 
 
219 aa  43.9  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2390  TonB family protein  32.65 
 
 
474 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.600506 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  28.57 
 
 
264 aa  43.1  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  30.77 
 
 
239 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  30.77 
 
 
239 aa  43.1  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  30.77 
 
 
239 aa  43.1  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  30.77 
 
 
244 aa  43.1  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>