129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3533 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  100 
 
 
266 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  98.12 
 
 
266 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  73.12 
 
 
273 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  72.22 
 
 
275 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  70.11 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  70.11 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  70.93 
 
 
275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  67.44 
 
 
285 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  68.48 
 
 
274 aa  132  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  70.93 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  68.24 
 
 
277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  68.24 
 
 
273 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  61.54 
 
 
276 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  44.92 
 
 
212 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  68.6 
 
 
264 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  44.37 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  45.45 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  67.44 
 
 
266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  47.79 
 
 
288 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  44.37 
 
 
287 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  34.78 
 
 
285 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  59.3 
 
 
253 aa  99.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  51.06 
 
 
274 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  51.61 
 
 
273 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  60.44 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  39.82 
 
 
256 aa  95.1  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  59.09 
 
 
267 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  42.6 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  42.6 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  50 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  48.28 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3737  TonB-like  56.38 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  48.31 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  49.45 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  51.65 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  49.45 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  50 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  45.35 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  38.89 
 
 
271 aa  70.1  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  47.5 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  42.86 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  38.3 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  35.04 
 
 
231 aa  67  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  35.04 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  45.45 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  41.67 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  44.16 
 
 
390 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  41.76 
 
 
259 aa  62  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  40.48 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  46.25 
 
 
117 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  42.31 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.84 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  37.35 
 
 
212 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  45.45 
 
 
267 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  25.91 
 
 
219 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  41.51 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  40 
 
 
140 aa  55.1  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  33.77 
 
 
319 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  43.14 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  30.92 
 
 
203 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  37.66 
 
 
215 aa  53.1  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  39.74 
 
 
234 aa  52.8  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  29.87 
 
 
218 aa  52.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  42.31 
 
 
441 aa  53.1  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  44.74 
 
 
219 aa  52.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  44.74 
 
 
219 aa  52.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  26.47 
 
 
203 aa  52.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  28.23 
 
 
267 aa  52  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  30.63 
 
 
244 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  35.29 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  32.14 
 
 
443 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  28.09 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  35.16 
 
 
264 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1020  TonB family protein  34.86 
 
 
290 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00268646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  30.26 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  42.11 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0951  TonB family protein  34.71 
 
 
295 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00168123  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  40.79 
 
 
238 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  40.26 
 
 
221 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  31.61 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1053  TonB family protein  34.86 
 
 
289 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0250994  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  31.65 
 
 
203 aa  50.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  40.26 
 
 
221 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  37.04 
 
 
137 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  32.91 
 
 
150 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  31.21 
 
 
252 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  36.96 
 
 
269 aa  49.3  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4005  TonB family protein  41.82 
 
 
248 aa  49.3  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  37.04 
 
 
137 aa  49.3  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  40.79 
 
 
258 aa  48.9  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  31.4 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  38.55 
 
 
283 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  31.17 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  35 
 
 
190 aa  48.5  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  41.67 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  41.49 
 
 
228 aa  48.5  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  28.57 
 
 
259 aa  47.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  40 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  34.27 
 
 
289 aa  47.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1514  TonB family protein  36.76 
 
 
331 aa  47  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>