136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4480 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  100 
 
 		 269 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  71.85 
 
 		 267 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  61.18 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  60.87 
 
 		 273 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  56.52 
 
 		 276 aa  112  9e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  61.18 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  61.18 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  59.78 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  59.78 
 
 		 266 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  46.62 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  60 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  60 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  38.43 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  57.14 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  55.29 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  55.29 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  57.14 
 
 		 274 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  56.67 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  41.73 
 
 		 288 aa  102  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  54.12 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2639  TonB family protein  51.76 
 
 		 285 aa  97.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  52.94 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5227  TonB family protein  58.82 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.631844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  52.22 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  51.76 
 
 		 228 aa  89.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  42.86 
 
 		 193 aa  87.8  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0295  TonB family protein  56.47 
 
 		 264 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.14734 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  41.07 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  41.07 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3737  TonB-like  53.85 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  38.89 
 
 		 248 aa  82  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  35.71 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  47.06 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  47.06 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  48.15 
 
 		 138 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  42.35 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  42.35 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  38.68 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  46.75 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  32.78 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  45.35 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  30.71 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  44.44 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  42.17 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  42.35 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  39.86 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  44.05 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  47.37 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  35.6 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  30.54 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  43.04 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  40.24 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01522  TonB protein  45.68 
 
 		 140 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  35.85 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  41.56 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  39.44 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  40.74 
 
 		 137 aa  58.2  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  37.97 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  40.74 
 
 		 137 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  40.74 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  40.74 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  33.77 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  45.45 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  45.45 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  31.92 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  31.92 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  34.31 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  33.6 
 
 		 1888 aa  55.8  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  36.36 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1664  TonB/TolA energy transducing protein  37.21 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0106366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  37.66 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  34.05 
 
 		 443 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  35.8 
 
 		 138 aa  53.9  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  28.33 
 
 		 264 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  40.26 
 
 		 234 aa  52.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3224  TonB family protein  37.97 
 
 		 413 aa  52  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222698  normal  0.927933 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  38.27 
 
 		 390 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  32.11 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  36.36 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3773  TonB family protein  35.29 
 
 		 475 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.854647  normal  0.705204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0017  TonB-like  45.9 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  36.96 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  40 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  39.24 
 
 		 441 aa  50.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01075  TonB family C-terminal domain protein  37.04 
 
 		 170 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453283  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06244  TonB family C-terminal domain protein  37.04 
 
 		 170 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.484779  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  31.11 
 
 		 292 aa  50.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  33.63 
 
 		 244 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  31.19 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  37.66 
 
 		 215 aa  48.9  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1523  TonB family protein  30.61 
 
 		 228 aa  48.9  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  28.24 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  35.8 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  33.33 
 
 		 228 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03160  TonB protein  44.44 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.444555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  36.9 
 
 		 285 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  30 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  33.33 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  30.7 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5044  TonB family protein  32.74 
 
 		 301 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.805089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>