38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1664 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1664  TonB/TolA energy transducing protein  100 
 
 		 337 aa  652    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0106366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1906  TonB-like  79.29 
 
 		 334 aa  411  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.338738  normal  0.207358 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1514  TonB family protein  51.55 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1247  TonB-like  32.43 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.406253 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0777  TonB family protein  35.79 
 
 		 141 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.114118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2086  TonB family protein  37.35 
 
 		 137 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  30.85 
 
 		 288 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  30.85 
 
 		 287 aa  51.2  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2174  TonB protein  36.14 
 
 		 137 aa  50.1  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4480  TonB, C-terminal  40 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0674  tonB domain protein  41.43 
 
 		 267 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  32.31 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  33.72 
 
 		 212 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  32.31 
 
 		 244 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  30.21 
 
 		 243 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  30.11 
 
 		 308 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  35.9 
 
 		 236 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  32.91 
 
 		 248 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  32.91 
 
 		 248 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  37.1 
 
 		 245 aa  45.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  32.91 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  32.91 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  32.91 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  31.82 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  32.91 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  32.91 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  31.82 
 
 		 276 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  37.88 
 
 		 244 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1840  TonB family protein  30.26 
 
 		 138 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.259302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  34.21 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  30.95 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  37.29 
 
 		 267 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  31.65 
 
 		 244 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  29.47 
 
 		 233 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  34.21 
 
 		 219 aa  42.7  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  34.21 
 
 		 219 aa  42.7  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  35 
 
 		 215 aa  42.4  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0486  TonB, C-terminal  34.29 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.544308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>