49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0777 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0777  TonB family protein  100 
 
 
141 aa  293  4e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.114118  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1514  TonB family protein  41.3 
 
 
331 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1664  TonB/TolA energy transducing protein  35.79 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0106366  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1906  TonB-like  32.99 
 
 
334 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.338738  normal  0.207358 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1247  TonB-like  29.75 
 
 
338 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.406253 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  40.54 
 
 
221 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  40.54 
 
 
221 aa  53.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  36.49 
 
 
249 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  32.56 
 
 
280 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  29.21 
 
 
276 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  35.53 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  34.72 
 
 
233 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  36.67 
 
 
244 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  32.93 
 
 
223 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  30.59 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  38.71 
 
 
245 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  36.67 
 
 
245 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  33.33 
 
 
219 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  30.34 
 
 
232 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1807  TonB family protein  32.1 
 
 
233 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.390031  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  40 
 
 
230 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  33.33 
 
 
234 aa  43.9  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  31.67 
 
 
244 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1801  putative TonB protein  31.67 
 
 
229 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.613166  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  32.81 
 
 
231 aa  43.5  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  36.84 
 
 
190 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2062  TonB domain-containing protein  31.67 
 
 
246 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0522  TonB domain-containing protein  23.08 
 
 
248 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  31.67 
 
 
248 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1090  TonB domain-containing protein  31.67 
 
 
246 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0798  TonB domain-containing protein  31.67 
 
 
246 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1932  siderophore-mediated iron transport protein  31.67 
 
 
229 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  26.88 
 
 
233 aa  42.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0271  tonB protein, putative  32.53 
 
 
273 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  28.57 
 
 
245 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  38.78 
 
 
234 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  26.88 
 
 
233 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0135  TonB, C-terminal  32.53 
 
 
274 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2237  TonB family protein  30 
 
 
243 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.988548  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2116  TonB family protein  30 
 
 
226 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  32.89 
 
 
219 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  32.89 
 
 
219 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  30 
 
 
269 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  31.25 
 
 
231 aa  40.4  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  35 
 
 
507 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  30 
 
 
259 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2675  TonB family protein  27.37 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.168048 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  30 
 
 
258 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  33.33 
 
 
218 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>