157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2156 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  100 
 
 		 219 aa  441  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  43.62 
 
 		 390 aa  88.6  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  40 
 
 		 259 aa  86.3  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  44.68 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  44.94 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  40.62 
 
 		 277 aa  76.3  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  30.32 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  36.96 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  34.46 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  37.08 
 
 		 275 aa  64.7  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21710  TonB-like protein, ferric siderophore transporter  37.66 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08080  TonB protein  37.66 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21840  TonB C-terminal domain protein, ferric siderophore transporter  37.66 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0453954  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0080  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  37.89 
 
 		 459 aa  62.8  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.163875 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  38.46 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  38.46 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  28.84 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  28.11 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  34.88 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  41.18 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  30.72 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  30.95 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  35.16 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0591  TonB family protein  34.07 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.664321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0218  TonB-like  35.53 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  32.29 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02490  hypothetical protein  32.47 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  28.4 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0279  hypothetical protein  32.47 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  33.33 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2481  tonB protein  35.53 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2605  TonB-like protein  31.58 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2287  TonB, C-terminal  35.53 
 
 		 277 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00257812  decreased coverage  0.0000380211 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  35.63 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3986  TonB family protein  31.58 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.152676 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3533  TonB family protein  31.58 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0725055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0227  TonB protein  28.21 
 
 		 275 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  37.66 
 
 		 212 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  35.11 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  24.88 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  32 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  35.71 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  31.31 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1585  TonB-like  30.77 
 
 		 263 aa  52  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.526469  normal  0.0167438 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  32.89 
 
 		 276 aa  52  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  33.72 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1093  TonB family protein  40.48 
 
 		 134 aa  52  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  34.88 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  34.88 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  28.89 
 
 		 582 aa  51.6  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  33.72 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  33.72 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  32.88 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  27.27 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  28.75 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2905  TonB family protein  30.68 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432378  normal  0.637635 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1422  TonB family protein  35.9 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  34.18 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  33.33 
 
 		 289 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  28.04 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  34.44 
 
 		 302 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  32.38 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  31.9 
 
 		 441 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  37.33 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  32.88 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  29.87 
 
 		 271 aa  49.7  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  31.63 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  32.05 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  32.05 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  31.43 
 
 		 301 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  31.96 
 
 		 243 aa  48.9  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  33.33 
 
 		 258 aa  48.9  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  31.17 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  31.17 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  30.89 
 
 		 231 aa  48.1  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  29.87 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01076  TonB protein  38.75 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147824  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0732  TonB family protein  29.87 
 
 		 268 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06243  TonB protein  38.75 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.442028  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1403  TonB family protein  30.89 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  32.05 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  32.05 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  33.75 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  27.43 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  31.65 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  32.88 
 
 		 117 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  29.11 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1963  TONB transmembrane protein  30.77 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  29.58 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  32.89 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  32.14 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  28.99 
 
 		 403 aa  46.6  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1987  TonB family protein  28.75 
 
 		 292 aa  45.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  29.55 
 
 		 565 aa  45.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0861  TonB family protein  29.49 
 
 		 244 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  29.47 
 
 		 112 aa  45.4  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  38.64 
 
 		 240 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  39.53 
 
 		 240 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  28.03 
 
 		 203 aa  45.1  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  32.89 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>