189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4564 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  100 
 
 		 203 aa  410  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  89.66 
 
 		 203 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  88.67 
 
 		 203 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  87.68 
 
 		 203 aa  371  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  81.28 
 
 		 203 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  80.79 
 
 		 203 aa  347  7e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  49.5 
 
 		 203 aa  187  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  44.39 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  45.37 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  35.61 
 
 		 204 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  36.73 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  38.78 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  37.37 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  37.37 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  35.27 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  37.37 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  34.02 
 
 		 206 aa  109  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  36.87 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  36.87 
 
 		 206 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  36.1 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  37.06 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  34.69 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  36.36 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  35.71 
 
 		 206 aa  105  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  31.98 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  33.33 
 
 		 207 aa  104  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  35.86 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  35.86 
 
 		 207 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  35.71 
 
 		 206 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  35.53 
 
 		 207 aa  103  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  32.66 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  49.45 
 
 		 131 aa  97.8  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  38.94 
 
 		 405 aa  87.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  41.18 
 
 		 368 aa  86.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  42.53 
 
 		 206 aa  86.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  29.95 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  46.07 
 
 		 367 aa  85.9  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  44.05 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  28.84 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  38.54 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  39.77 
 
 		 397 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  39.02 
 
 		 349 aa  75.1  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  43.59 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  30.5 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  40.22 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  38.37 
 
 		 370 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  37.21 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  46.03 
 
 		 371 aa  71.2  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  36.78 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  41.18 
 
 		 417 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  46.03 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  50 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  38.04 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  41.86 
 
 		 392 aa  68.2  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  35.29 
 
 		 369 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  31.19 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  39.02 
 
 		 115 aa  67  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  37.21 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  37.65 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  39.02 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  44.44 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  34.88 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  46.88 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3288  TonB family protein  36.84 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.634309  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  33.71 
 
 		 361 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  35.45 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  40.45 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  37.08 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  28.04 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  38.82 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  37.65 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  39.44 
 
 		 373 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  34.17 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  35.63 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  36.36 
 
 		 354 aa  62  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  38.37 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  34.88 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  35.9 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  32.38 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  36.84 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  36.84 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  36.84 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  33.75 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  36.78 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  36.19 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  38.03 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  38.03 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  38.03 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  38.03 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  35.48 
 
 		 252 aa  58.2  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  38.03 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  39.24 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  38.03 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  38.03 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  38.03 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  35.24 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  35.24 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  33.72 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  33.72 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3868  TonB family protein  40.43 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>