187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0905 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  100 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  45.77 
 
 		 203 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  45.77 
 
 		 203 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  44.78 
 
 		 203 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  45.27 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  44.78 
 
 		 203 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  44.39 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  43.48 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  42.33 
 
 		 202 aa  143  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  37.63 
 
 		 206 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  37.95 
 
 		 207 aa  121  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  37.63 
 
 		 206 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  37.63 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  37.63 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  38.46 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  38.46 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  38.14 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  37.95 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  36.55 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  36.04 
 
 		 206 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  36.79 
 
 		 207 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  36.87 
 
 		 205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  36.08 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  37.44 
 
 		 206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  36.6 
 
 		 206 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  34.52 
 
 		 204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  35.79 
 
 		 219 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  34.18 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  48.35 
 
 		 131 aa  95.9  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  32.99 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  31.43 
 
 		 206 aa  89.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  29.95 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  32.56 
 
 		 217 aa  85.1  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  28.92 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  39.77 
 
 		 368 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  42.39 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  28.43 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  35.16 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  38.82 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  39.53 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  37.63 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  38.71 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  36.05 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  42.86 
 
 		 403 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  44.19 
 
 		 404 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  30.46 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  39.08 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  38.2 
 
 		 371 aa  70.9  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  37.5 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  46.03 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  38.46 
 
 		 349 aa  68.6  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  35.29 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  44.44 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  32.03 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  38.82 
 
 		 417 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  36.84 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  48.21 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  36.47 
 
 		 396 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  34.44 
 
 		 391 aa  65.1  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  41.43 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  31.76 
 
 		 369 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3332  TonB family protein  32.58 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00224785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  34.04 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0632  TonB family protein  32.56 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  37.65 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03563  TonB domain protein  36.05 
 
 		 392 aa  62.4  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0576  TonB family protein  32.56 
 
 		 370 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0547  TonB family protein  32.94 
 
 		 369 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  31.03 
 
 		 371 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  28.46 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  34.83 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  31.03 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0571  TonB family protein  34.15 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.480586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  39.44 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  29.79 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2270  TonB family protein  36.9 
 
 		 368 aa  59.3  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00628561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  33.33 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  37.93 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  31.65 
 
 		 458 aa  58.5  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  44.62 
 
 		 93 aa  58.5  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  38.1 
 
 		 340 aa  58.2  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  34.15 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  43.28 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  37.35 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  38.24 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  40.26 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  34.52 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  36.62 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3763  TonB family protein  33.8 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3888  TonB family protein  36.71 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  34.78 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  31.94 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  31.62 
 
 		 244 aa  54.7  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  41.67 
 
 		 275 aa  53.9  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  29.01 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  33.78 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  33.03 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  30.19 
 
 		 255 aa  52.4  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  39.44 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  34.67 
 
 		 252 aa  52  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>