141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1880 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  100 
 
 
243 aa  478  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  97.49 
 
 
239 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  98.77 
 
 
244 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  98.36 
 
 
244 aa  363  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  98.74 
 
 
239 aa  354  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  98.74 
 
 
239 aa  354  5.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  98.74 
 
 
239 aa  354  5.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  98.74 
 
 
239 aa  354  5.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  98.33 
 
 
239 aa  352  2e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  85.06 
 
 
240 aa  322  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  84.65 
 
 
240 aa  321  8e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  79.84 
 
 
242 aa  319  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  79.42 
 
 
242 aa  317  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  78.6 
 
 
242 aa  314  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  62.4 
 
 
264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  46.8 
 
 
249 aa  162  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  52.48 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  51.77 
 
 
251 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  66.28 
 
 
238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  52.27 
 
 
248 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  46.51 
 
 
256 aa  111  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  46.51 
 
 
252 aa  111  9e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  46.51 
 
 
256 aa  111  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3288  TonB family protein  41.86 
 
 
194 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.634309  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0759  TonB family protein  47.67 
 
 
314 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  47.56 
 
 
342 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  49.35 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  33.55 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  36.46 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0941  putative membrane protein, energy transducer  38.46 
 
 
108 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1274  TonB domain protein  38.46 
 
 
108 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  33.1 
 
 
203 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  35.81 
 
 
203 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  38.1 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  47.37 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  34.46 
 
 
203 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  31.12 
 
 
249 aa  60.5  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  32.35 
 
 
209 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  34.19 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  32.67 
 
 
203 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  37.5 
 
 
417 aa  59.3  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  34.46 
 
 
203 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  38.71 
 
 
206 aa  59.3  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  48.39 
 
 
205 aa  58.5  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  35.71 
 
 
206 aa  58.5  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  36.47 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  36.14 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  29.03 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  32 
 
 
403 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  34.12 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  38.27 
 
 
242 aa  56.6  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  37.18 
 
 
397 aa  56.6  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  31.64 
 
 
228 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  37.18 
 
 
458 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0668  TonB domain-containing protein  31.54 
 
 
193 aa  56.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  45.61 
 
 
334 aa  56.6  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  35.37 
 
 
207 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  35.37 
 
 
207 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  41.54 
 
 
202 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  41.94 
 
 
206 aa  55.8  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  33.33 
 
 
131 aa  55.5  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  37.04 
 
 
206 aa  55.1  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  40 
 
 
206 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  32.61 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  34.15 
 
 
207 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  34.15 
 
 
206 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  28.69 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  27.55 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  35.82 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  35.82 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  35.82 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  35.82 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  31.65 
 
 
404 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  38.98 
 
 
371 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  33.33 
 
 
283 aa  53.5  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  36.67 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  35 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  35.37 
 
 
207 aa  53.1  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  38.6 
 
 
115 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  29.13 
 
 
203 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  32.81 
 
 
405 aa  52.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  33.87 
 
 
207 aa  52  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  31.62 
 
 
443 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  40.32 
 
 
391 aa  52  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  35.82 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  35.19 
 
 
93 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  26.12 
 
 
277 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  35.71 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  36.67 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  37.29 
 
 
371 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2441  TonB family protein  35.38 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.124389  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  38.71 
 
 
369 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  33.87 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  33.33 
 
 
582 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  30.63 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  26.83 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  41.82 
 
 
223 aa  49.3  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  32.84 
 
 
206 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  29.52 
 
 
287 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  29.17 
 
 
203 aa  48.9  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>