99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1274 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0941  putative membrane protein, energy transducer  100 
 
 		 108 aa  227  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1274  TonB domain protein  100 
 
 		 108 aa  227  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  42.31 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  42.31 
 
 		 240 aa  74.7  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  41.03 
 
 		 242 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  41.03 
 
 		 240 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  41.03 
 
 		 242 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  41.03 
 
 		 242 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  38.96 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  38.46 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  38.46 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  38.46 
 
 		 244 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  38.46 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  36.59 
 
 		 249 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  38.46 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  38.46 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  38.46 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  38.46 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  34.88 
 
 		 251 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  34.88 
 
 		 252 aa  70.5  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  33.67 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  40.85 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  43.75 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  43.75 
 
 		 256 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  43.75 
 
 		 256 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  37.21 
 
 		 223 aa  60.5  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  37.66 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  38.24 
 
 		 417 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  50 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  49.18 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  38.36 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0759  TonB family protein  34.78 
 
 		 314 aa  57  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3288  TonB family protein  32.18 
 
 		 194 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.634309  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  30.39 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  39.68 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  39.34 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  39.34 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  39.34 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  39.34 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  39.34 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  39.34 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  37.7 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  37.7 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  37.7 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  37.7 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  34.57 
 
 		 404 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  32.05 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  31.65 
 
 		 334 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  37.7 
 
 		 203 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  34.92 
 
 		 219 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  36.07 
 
 		 203 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  36.07 
 
 		 203 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  32.56 
 
 		 467 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  36.07 
 
 		 203 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  30.34 
 
 		 206 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  36.07 
 
 		 203 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  36.07 
 
 		 206 aa  50.4  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  34.78 
 
 		 203 aa  50.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  30.14 
 
 		 405 aa  50.4  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  39.29 
 
 		 228 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  34.25 
 
 		 340 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  29.17 
 
 		 371 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  36.07 
 
 		 206 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  29.17 
 
 		 371 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  34.43 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  34.43 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  29 
 
 		 204 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  34.43 
 
 		 206 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  39.06 
 
 		 227 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  40 
 
 		 242 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  36.07 
 
 		 217 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  32.79 
 
 		 207 aa  47  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  37.04 
 
 		 205 aa  47  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  34.43 
 
 		 203 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  32.79 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  38.98 
 
 		 391 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  31.43 
 
 		 260 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  32.39 
 
 		 207 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  36.67 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  33.9 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  28.57 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  32.73 
 
 		 115 aa  44.7  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  29.69 
 
 		 368 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  27.84 
 
 		 206 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  32.14 
 
 		 248 aa  43.9  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  30.86 
 
 		 259 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  32.26 
 
 		 390 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1478  TonB protein  32.35 
 
 		 231 aa  42.7  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  33.93 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  34.55 
 
 		 221 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  29.51 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  38.18 
 
 		 270 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  36.36 
 
 		 93 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5449  TonB-like  41.82 
 
 		 218 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0228377 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  29.03 
 
 		 251 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  31.25 
 
 		 237 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0079  TonB family protein  37.88 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.416956 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  28.09 
 
 		 206 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  31.25 
 
 		 283 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>