220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2615 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  100 
 
 		 467 aa  960    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5187  peptidase M56 BlaR1  31.21 
 
 		 750 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2876  peptidase M56 BlaR1  25.41 
 
 		 465 aa  84  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6205  peptidase M56 BlaR1  32.37 
 
 		 671 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.86421 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2587  peptidase M56 BlaR1  30.25 
 
 		 858 aa  76.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0579  peptidase M56, BlaR1  28 
 
 		 541 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0288  peptidase M56 BlaR1  25.24 
 
 		 651 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  40.7 
 
 		 206 aa  73.2  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1176  hypothetical protein  30.63 
 
 		 640 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1007  hypothetical protein  29.94 
 
 		 629 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1934  peptidase M56 BlaR1  32.54 
 
 		 647 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1079  hypothetical protein  29.94 
 
 		 629 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3888  peptidase M56, BlaR1  28.57 
 
 		 631 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0994  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  30.5 
 
 		 632 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0209  peptidase M56, BlaR1  24.75 
 
 		 660 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3297  peptidase M56, BlaR1  29.35 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  30 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  27.43 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5199  peptidase M56 BlaR1  24.09 
 
 		 477 aa  69.7  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.973642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3722  peptidase M56 BlaR1  26.15 
 
 		 631 aa  70.1  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.616369  normal  0.219221 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2068  peptidase M56 BlaR1  25.65 
 
 		 632 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.999712  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0431  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like protein  29.73 
 
 		 442 aa  69.7  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1111  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  28.39 
 
 		 589 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1140  peptidase M56 BlaR1  22.27 
 
 		 598 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  35.71 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1810  peptidase M56, BlaR1  29.57 
 
 		 750 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  36.78 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2753  peptidase M56 BlaR1  25.43 
 
 		 581 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.395295 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3127  peptidase M56, BlaR1  28.05 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000359349  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  40 
 
 		 115 aa  63.9  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  46.03 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0731  peptidase M56 BlaR1  27.87 
 
 		 719 aa  63.9  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  27.14 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3351  Beta-lactamase  25.15 
 
 		 596 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2615  cell wall hydrolase/autolysin  28.65 
 
 		 562 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3146  peptidase M56, BlaR1  25.51 
 
 		 728 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  34.44 
 
 		 228 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3238  tonB protein, putative  34.88 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2408  beta-lactamase regulatory protein 1; methicillin resistance protein  25.75 
 
 		 619 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  37.18 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  33.33 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  37.18 
 
 		 252 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  37.18 
 
 		 256 aa  62.4  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  29.41 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  36.11 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  34.83 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  34.88 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  30 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3787  peptidase M56 BlaR1  25.37 
 
 		 617 aa  60.1  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.536626  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  38.71 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  33.33 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4060  TonB family protein  30.23 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.910663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  33.72 
 
 		 202 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3587  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1122 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.479804  normal  0.0414977 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  27.61 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  32.56 
 
 		 206 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  34.88 
 
 		 205 aa  58.9  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  39.73 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  38.24 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  29.82 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  28.26 
 
 		 447 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  36.47 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  30.33 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1016  peptidase M56 BlaR1  23.33 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.196488  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  29.76 
 
 		 391 aa  57  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  31.9 
 
 		 368 aa  57  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  38.46 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  34.18 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  33.87 
 
 		 238 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  42.19 
 
 		 203 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  42.19 
 
 		 203 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  42.19 
 
 		 203 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  33.85 
 
 		 252 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  42.19 
 
 		 203 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05000  TonB protein  28.89 
 
 		 290 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00767831  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  42.19 
 
 		 203 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  33.85 
 
 		 251 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2087  TonB family protein  34.78 
 
 		 219 aa  55.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.000490312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  32.35 
 
 		 371 aa  55.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  32.97 
 
 		 223 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  26.09 
 
 		 397 aa  55.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  32.35 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  33.66 
 
 		 700 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  41.67 
 
 		 289 aa  53.9  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0377  peptidase M56, BlaR1  33.33 
 
 		 302 aa  53.9  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  40.62 
 
 		 203 aa  53.5  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  31.82 
 
 		 441 aa  53.5  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  30.95 
 
 		 334 aa  53.5  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  35.21 
 
 		 443 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  30.95 
 
 		 207 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  31.82 
 
 		 747 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  24.21 
 
 		 227 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0941  putative membrane protein, energy transducer  32.56 
 
 		 108 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2099  peptidase M56 BlaR1  26.9 
 
 		 614 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  39.66 
 
 		 260 aa  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  30.93 
 
 		 219 aa  52.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4715  peptidase M56 BlaR1  29.93 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0923928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1274  TonB domain protein  32.56 
 
 		 108 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  36.23 
 
 		 390 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  30.95 
 
 		 206 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>