171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3972 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  100 
 
 		 223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  61 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  60 
 
 		 202 aa  209  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  37.69 
 
 		 199 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  33.94 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  28.71 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  30.28 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  27.4 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  32.18 
 
 		 204 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  29.1 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  40.82 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  23.9 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  27.18 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  29.25 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  30.29 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  30 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  31.61 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  30.77 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  28.97 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  32.89 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  40 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  31.61 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  32.89 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  26.21 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  40.66 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  37.25 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  37.78 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  38.89 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  37.78 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  37.78 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  37.5 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  33.6 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  37.78 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  37.78 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  35.29 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  35.29 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  37.78 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  40.95 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  37.78 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  36.67 
 
 		 131 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  40.95 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  40.43 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  28.9 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4060  TonB family protein  37.78 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.910663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0712  TonB family protein  44.87 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.877696  normal  0.702571 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2156  TonB-like  30.18 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  41.03 
 
 		 390 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  50.85 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3238  tonB protein, putative  38.64 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.70516  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05000  TonB protein  41.38 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00767831  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  46.48 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  27.64 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  34.25 
 
 		 403 aa  62.4  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  42.25 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  27.1 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  30.56 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  34.69 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  34.88 
 
 		 467 aa  59.7  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  31.58 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  46.03 
 
 		 371 aa  58.9  0.00000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  34.48 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1619  TonB-like protein  40.3 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.338582  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  46.03 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0876  TonB family protein  27.88 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  36.05 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  35.29 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  34.38 
 
 		 458 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  32.18 
 
 		 391 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  29.58 
 
 		 405 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  32.26 
 
 		 417 aa  52.8  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  38.46 
 
 		 319 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0113  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.58 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.158306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0148  TonB-like protein  31.58 
 
 		 244 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000978892  hitchhiker  0.00708657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  41.27 
 
 		 334 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  44.62 
 
 		 447 aa  51.6  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  35.9 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  34.88 
 
 		 367 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  35.9 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0079  TonB family protein  44.26 
 
 		 148 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.416956 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  35.9 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  35.9 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  35.9 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  41.82 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3868  TonB family protein  35.37 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  35.9 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  31.76 
 
 		 397 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  35.9 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  35.9 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02801  TonB protein  39.68 
 
 		 340 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3288  TonB family protein  34.78 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.634309  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  32.93 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  36.36 
 
 		 308 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  41.67 
 
 		 349 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  38.46 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  31.76 
 
 		 404 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  30.12 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1980  TonB family protein  39.13 
 
 		 859 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3146  TonB family protein  27.63 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00104452  normal  0.89985 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0619  TonB domain-containing protein  36.59 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.938993  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  40.74 
 
 		 242 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.796983 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>