90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001860 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001860  ferric siderophore transport system binding protein TonB  100 
 
 		 210 aa  421  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00633  periplasmic protein TonB  90 
 
 		 209 aa  321  6e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  33.05 
 
 		 217 aa  98.2  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  31.8 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  29.61 
 
 		 207 aa  85.1  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  31.31 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1064  TonB family protein  32.57 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  32.82 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03431  putative TonB2 protein  33.18 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  32.7 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3075  TonB family protein  31.46 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2648  TonB family protein  37.7 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0343675  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  31.78 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  30.81 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  30.81 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2421  TonB-like protein  33.18 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00537232  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2622  TonB family protein  33.01 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.083203  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1258  TonB-like protein  32.65 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.973667  hitchhiker  0.0001567 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0115  TonB protein  28.28 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02810  TonB2 protein  47.44 
 
 		 131 aa  72  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.417398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1575  TonB family protein  37.96 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00700508  normal  0.018049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2986  TonB family protein  31.47 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.328592  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  29.3 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  30.35 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  30.35 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  30.39 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  34.68 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  26.9 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2474  TonB family protein  31.66 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.945787  hitchhiker  0.0000507957 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  29.85 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  28.02 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  33.59 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  27.35 
 
 		 259 aa  61.6  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  28.99 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0905  TonB-like protein  28.04 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06756  hypothetical protein  24.88 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  27.4 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000844  ferric siderophore transport system binding protein TonB  27.32 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  26.87 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  33.71 
 
 		 112 aa  53.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  26.24 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  26.83 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  25.25 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0077  TonB-like protein  38.82 
 
 		 150 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2344  TonB family protein  38.1 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.388453  hitchhiker  0.00869444 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  29.58 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0009  TonB protein  38.46 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0009  TonB family protein  38.46 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  38.75 
 
 		 244 aa  48.9  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  38.75 
 
 		 244 aa  48.9  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1862  TonB-like protein  33.33 
 
 		 332 aa  48.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  33.96 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  34.83 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3481  TonB family protein  33.33 
 
 		 363 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00509083  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2444  TonB domain-containing protein  34.52 
 
 		 361 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0960107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  33.78 
 
 		 251 aa  47  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  31.08 
 
 		 458 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  32.94 
 
 		 367 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  34.57 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  33.7 
 
 		 269 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  32.47 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4804  TonB domain-containing protein  35.29 
 
 		 349 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2774  TonB family protein  33.33 
 
 		 354 aa  45.8  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0960618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  36.36 
 
 		 93 aa  45.4  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2537  TonB family protein  31.03 
 
 		 190 aa  45.1  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  32.98 
 
 		 565 aa  45.1  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1002  TonB family protein  33.75 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685032 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3868  TonB family protein  47.92 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  36.92 
 
 		 371 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3286  TonB family protein  34.67 
 
 		 368 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1444  TonB family protein  36.92 
 
 		 371 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.232122  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2999  TonB family protein  36 
 
 		 396 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  36.25 
 
 		 288 aa  43.5  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  36.36 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0873  TonB family protein  32.89 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1494  putative GAF sensor protein  34.62 
 
 		 582 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.980694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  33.33 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  31.51 
 
 		 403 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0356  periplasmic protein TonB  23.86 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0245094  normal  0.451591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  36.25 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3738  TonB family protein  31.71 
 
 		 404 aa  42.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.595285  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4383  TonB domain/peptidase M56 domain-containing protein  27.71 
 
 		 700 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  36.84 
 
 		 258 aa  42.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  31.94 
 
 		 256 aa  42.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  31.94 
 
 		 252 aa  42.4  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  31.4 
 
 		 371 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  31.4 
 
 		 371 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4043  TonB domain-containing protein  27.91 
 
 		 369 aa  41.6  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0245  TonB-like protein  28.24 
 
 		 255 aa  41.6  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.854856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  32.56 
 
 		 212 aa  41.6  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>