228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1236 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1236  TonB family protein  100 
 
 
269 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3059  TonB family protein  44.37 
 
 
285 aa  109  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1244  TonB family protein  58.24 
 
 
267 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000480451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2766  TonB family protein  40.62 
 
 
249 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2742  TonB family protein  39.05 
 
 
301 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0491  TonB family protein  48.31 
 
 
283 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.112802 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  41.35 
 
 
390 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  41.38 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0876  TonB-like protein  37.36 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000261877  normal  0.0876537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1020  TonB-like protein  37.36 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000273603  normal  0.0339055 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0573  TonB family protein  38.04 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.365286 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1487  TonB family protein  41.38 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1202  TonB family protein  41.38 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000141399 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  40.24 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4496  TonB, C-terminal  40.7 
 
 
237 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  35.58 
 
 
237 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1049  TonB-like  42.31 
 
 
223 aa  63.9  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  40 
 
 
280 aa  63.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1560  TonB-like protein  39.33 
 
 
276 aa  63.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0439  TonB domain-containing protein  42.86 
 
 
215 aa  62.8  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.31739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0910  TonB protein  45.68 
 
 
234 aa  62.4  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.979068  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  35.71 
 
 
233 aa  62.4  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  39.53 
 
 
225 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  41.33 
 
 
221 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0385  TonB family protein  30.77 
 
 
112 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.796996 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  31.03 
 
 
289 aa  60.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1141  TonB family protein  33.98 
 
 
234 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1116  TonB, C-terminal  28.42 
 
 
212 aa  59.3  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.117664 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0441  TonB domain-containing protein  34.96 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0456  TonB-like  35.71 
 
 
223 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00460811  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001355  ferric siderophore transport system binding protein TonB  39.53 
 
 
218 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0107998  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3561  TonB family protein  40 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  35.44 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1442  TonB family protein  36.47 
 
 
233 aa  57  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3842  TonB family protein  25.91 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2640  TonB family protein  37.84 
 
 
447 aa  57  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.120192  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0168  TonB family protein  45.33 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.500537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1629  TonB family protein  33.33 
 
 
206 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.589143  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4650  TonB family protein  40.79 
 
 
292 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0654653  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2406  TonB family protein  36.47 
 
 
233 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.667004 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1644  TonB family protein  33.33 
 
 
206 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.219382  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05244  hypothetical protein  38.37 
 
 
243 aa  56.2  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2277  TonB-like protein  38.67 
 
 
219 aa  56.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380607  normal  0.0262675 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  33.33 
 
 
275 aa  56.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  31.52 
 
 
604 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1666  TonB family protein  33 
 
 
206 aa  55.8  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.13034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4255  TonB family protein  37.5 
 
 
441 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.510243  normal  0.585691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4093  TonB, C-terminal  38.55 
 
 
228 aa  55.8  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2460  TonB family protein  34.38 
 
 
207 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.43169  hitchhiker  0.0000000910497 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2530  TonB family protein  34.38 
 
 
207 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0930867  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2714  TonB family protein  33 
 
 
206 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0362691  decreased coverage  0.0000000109888 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1009  TonB family protein  35.16 
 
 
565 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0137762 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3140  TonB protein  39.24 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.426422  normal  0.0468636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5812  TonB family protein  39.24 
 
 
117 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.686482  normal  0.162663 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0753  TonB family protein  29.91 
 
 
230 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.553846  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2622  TonB family protein  33.33 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052579  hitchhiker  0.00000122116 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1603  TonB family protein  42.55 
 
 
860 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00363915  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1828  TonB2 protein  30.23 
 
 
207 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2268  TonB domain-containing protein  36.9 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.717597  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0552  TonB-like  34.09 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2903  TonB family protein  43.75 
 
 
218 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0411  TonB family protein  40 
 
 
906 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0636  TonB family protein  30.68 
 
 
265 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0184  TonB family protein  43.48 
 
 
267 aa  53.1  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.140188 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  34.78 
 
 
217 aa  53.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  30.43 
 
 
143 aa  52.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3603  TonB family protein  35 
 
 
371 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  37.35 
 
 
232 aa  53.1  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  28.57 
 
 
668 aa  52.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  30.95 
 
 
259 aa  52.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3718  periplasmic protein/ biopolymer transport  35.06 
 
 
238 aa  52.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5527  TonB-like protein  35.8 
 
 
243 aa  52  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  31.76 
 
 
156 aa  52.4  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3214  TonB-like protein  36.14 
 
 
357 aa  52  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0817874  normal  0.797935 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  26.09 
 
 
251 aa  52  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3076  TonB family protein  37.35 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00417889  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  35.06 
 
 
245 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3752  putative TonB protein  32.04 
 
 
203 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.208637  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4762  TonB domain-containing protein  35.71 
 
 
367 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2536  TonB family protein  35.9 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1521  TonB family protein  29.46 
 
 
206 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  34.52 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1078  TonB family protein  33.73 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0839  TonB family protein  37.21 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0400765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1409  TonB family protein  36.71 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.103412 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1960  TonB family protein  30 
 
 
271 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00999547  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0810  TonB-like protein  27.91 
 
 
614 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904031  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3429  TonB family protein  33.75 
 
 
371 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2085  TonB family protein  38.75 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.744558  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1945  TonB family protein  33.73 
 
 
245 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2235  TonB, C-terminal  36.36 
 
 
218 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  33.33 
 
 
228 aa  50.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0523  TonB family protein  33.75 
 
 
371 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  27.89 
 
 
220 aa  50.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  35.71 
 
 
274 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3521  TonB family protein  31.11 
 
 
212 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1508  TonB family protein  29.27 
 
 
121 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  34.41 
 
 
143 aa  49.7  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1010  TonB family protein  32 
 
 
466 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0128587 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0606  TonB family protein  28.32 
 
 
250 aa  49.7  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>